第三章第三章 序列比对序列比对主讲教师：丁彦蕊主讲教师：丁彦蕊单位：信息工程学院单位：信息工程学院序列比对：序列比对：寻找两条或者两条以上的序寻找两条或者两条以上的序列中各个字符的一一对应关系。列中各个字符的一一对应关系。序列比对的根本任务：序列比对的根本任务：发现序列之间的相似性发现序列之间的相似性寻找共同区域寻找共同区域辨别序列之间的差异辨别序列之间的差异目的：目的：相似序列相似序列 相似的相似的结构，相似的功能结构，相似的功能 判别序列之间的同源性判别序列之间的同源性推测序列之间的进化关系推测序列之间的进化关系 第一节第一节 序列的相似性序列的相似性同源（同源（homology）-具有共同的祖先具有共同的祖先(P81)直向同源（直向同源（Orthologous）:共同祖先的直接后代共同祖先的直接后代（没有发生基因复制事件）之间的同源基因称为直（没有发生基因复制事件）之间的同源基因称为直向同源。向同源。共生同源（共生同源（paralogous）:两个物种两个物种A和和B的同源基的同源基因，分别是共同祖先基因组中由复制事件而产生的因，分别是共同祖先基因组中由复制事件而产生的不同拷贝的
