分子对接及分子对接及Autodock的使用的使用11.概念2.原理3.一般过程4.分类5.代表性软件6.AUTODOCK软件7.参考文献2分子对接分子对接分子对接是通过研究配体小分子和受体生物大分子的相互作用，预测其亲和力，实现基于结构的药物设计的一种重要方法。整体上考虑配体与受体的结合效果，较好的避免局部作用、整体结合欠佳的情况。31 分子对接的概念4已知三维结构数据库中的分子放在靶标分子的活性位点处优化（受体化合物的位置、构象、分子内部可旋转键的二面角和受体的氨基酸残基侧链和骨架）寻找受体小分子化合物与靶标大分子作用的最佳构象预测其结合模式、亲和力通过打分函数挑选出接近天然构象的与受体亲和力最佳的配体52 分子对接的原理配体与受体结合时，彼此存在静电相互作用、氢键相互作用、范德华力相互作用和疏水作用力。配体与受体结合必须满足互相匹配原则，即配体与受体几何形状互补匹配、静电相互作用互补匹配、氢键相互作用互补匹配、疏水相互作用互补匹配。6理论基础：“锁和钥匙模型”“诱导契合模型”重要原则：互补性：决定识别过程的选择性预组织性：决定识别过程的结合能力分子对接的最初思想起源于Fisher
