计算机药物辅助设计caddppt课件.ppt

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1/8/2023化学信息学(Chemoinformatics,chemical informatics,Cheminformatics,chemi-informatics)利用计算机信息处理技术对化学分子结构,性质,来源及用途等相关信息进行管理(包括储存,分析,处理,检索和传递等)的一种综合性技术和学科。应用化学信息学可促进化学信息的获取、转化与共享 化学信息处理2D:3D:H3CC化学分子结构的层次1D:CH3CHOOH*一、2D和3D分子结构的计算机处理方法(一)以一维形式表示对2D结构进行编码储存和交换化学结构式数据的命名法 SMILES(Simplified Molecular Input Line Entry System,简化分子线性输入系统)SLN(Sybyl linear notation,Sybyl线性标记法)*SMILES按化合价模型,每个原子被氢原子饱和;双键用=表示;三键用#表示;环化分子用闭合原子序号表示;芳香环中不饱和原子用小写字母表示甲烷CH4C水乙醇H2O OC2H5OH CCO氰化氢 HCN C#N环已烷 C6H12C1CCCCC1吡啶C5H5N n1

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