多序列多序列联配和配和系系统进化化树组织构建构建序列同源性分析序列同源性分析 当我当我们在研究一个蛋白在研究一个蛋白质或基因或基因时，经常会考常会考虑这样一个很基本一个很基本的的问题：它与其他蛋白：它与其他蛋白质的同源性关系如何？的同源性关系如何？序列同源性分析：序列同源性分析：是是将将待待研研究究序序列列加加入入到到一一组与与之之同同源源，但但来来自自不不同同物物种种的的序序列列中中进行行多多序序列列同同时比比较，以以确确定定该序序列列与与其其它它序序列列间的的同同源源性性大大小小。这是理是理论分析方法中最关分析方法中最关键的一步。的一步。由于同源序列通常保持了相似的由于同源序列通常保持了相似的结构和功能，因而多序列比构和功能，因而多序列比对就就显得很有意得很有意义。尽管可以尽管可以对蛋白蛋白质、DNA序列序列进行多重比行多重比对，但是很多数据，但是很多数据库的比的比对只只针对蛋白蛋白质家族。家族。实际应用中常用中常进行氨基酸序列的多序列比行氨基酸序列的多序列比对，然后，然后转化成相化成相应的的DNA比比对多序列比多序列比对的定的定义 蛋白家族的特征是用存在一蛋白家族的特征是用存在一
