1、网络药理虚拟筛选方法简介刘 培2013-2-25什么是网络药理学？v从系统生物学和生物网络平衡的角度阐释疾病的发生发展过程；v从改善或恢复生物网络平衡的整体观角度认识药物与机体的相互作用并指导新药发现。 在高通量组学数据分析、计算机模拟计算及网络数据库检索的基础上，进行生物网络的构建及分析，进而进行药物作用机制的研究及创新药物的发现2网络药理学的研究思路v思路一： 根据 公共数据库和公开发表的已有数据，建立特定药物作用机制网络预测模型，预测药物作用靶点 /机制，从生物网络平衡的角度解析药物作用的药理学机制；v思路二： 利用 各种组学技术以及高内涵 /高通量技术，观察药物对模型 ( 分子、细胞、
2、组织或 /和动物 ) 的作用或模型对药物的作用，针对所产生的大量数据，采用生物信息学的手段分析和构建药物 -靶点 -疾病网络，建立预测模型，进而解析所研究药物的网络药理学机制 。3虚拟筛选步骤v一、准备待筛选分子v二、靶点筛选v三、通路筛选v四、网络药理图4一 、准 备 待 筛选 分子Chembiooffice2008以上版本作 图 ，文件 格式 须为 sdf5二、 靶点 筛选http:/59.78.96.61/pharmmapper/点 击 此 处 上 传 分 子 结 构，每次只能投入 1个分子 结 构6Jod ID是下 载结 果的 “密 码 ”7下 载结 果8Fit为 分子和靶点的匹配度，越 高代表越匹配 。靶点名称与人 类 相关的靶点代 码9三 、通路的 筛选将前面工作中得到的与人 类 相关的靶点代 码 全部 换 成类 似于 P00517 的形式，以投入博奥数据 库 得到与靶点相关的通路。 以靶点 PDPK1_HUMAN 为 例：http:/www.uniprot.org/此 为 蛋白 编 号靶点蛋白名称10
