1、1.1、生物大分子种类:蛋白质、糖类、脂类、核酸1.2、生物大分子的相互作用力:(主要是非共价作用力,即次级键,包括氢键、范德华引力、疏水作用力、盐键等)2.1 、miRNA:又称微小 RNA,是指植物和动物细胞中自然产生的一类长度为 1825bp 的小分子 RNA。3.1、顺反子(遗传学上的最小单位)是一段核苷酸序列,能编码一条完整的多肽链,这种多肽链既可以是一种生物活性的蛋白质,也可与其他多肽聚合而形成复杂的蛋白质。顺反子中最小交换单位(交换子)和最小突变单位(突变子)都是 DNA 分子中的一个核苷酸对。3.2、在不连续基因中有编码功能的区段称为外显子(exon) ,无编码功能的区段称为内
2、含子(intron) 。3.3 、ORF:可读框,是指从起始密码子起到终止密码子为止的一段连续的密码子区域,或在 DNA 序列测定中由计算机系统辨别认出的可能的编码区域 4.1、8. 参与 DNA 复制有关的酶和蛋白质?(1) 、DnaA识别起始序列,在起始特异性位置解开双链、 (2) 、DnaB 解开 DNA 双链、 (3) 、DnaC帮助 DnaB 结合于起点、 (4) 、HU类组蛋白, DNA 结合蛋白,促进起始(5) 、DnaG(引物合成酶)合成 RNA 引物(6) 、SSB(单链 DNA 结合蛋白)结合单链 DNA、 (7) 、RNA 聚合酶促进 DnaA 活性、 (8) 、DNA
3、解旋酶(拓扑异构酶 II)释放 DNA 解链过程中产生的扭曲张力、 (9) 、Dam 甲基化酶 使起点 GATC 序列的腺嘌呤甲基化。4.2、前导链(leading strand):与复制叉移动的方向一致,通过连续的 5-3聚合合成的新的 DNA 链。后随链或滞后链(lagging strand):与复制叉移动的方向相反,通过不连续的 5-3聚合合成的新的 DNA 链。又称滞后链5.1、点突变(碱基对置换):DNA 错配碱基在复制后被固定下来。由原来的一个碱基对被另一个碱基对取代。碱基对置换有两种类型:转换(transition) ,指两种嘧啶或两种嘌呤之间互换;颠换(transversion
4、) ,发生在嘧啶和嘌呤之间的互换。6.1、DNA 重组类型:同源重组、位点特异性重组、转座重组和异常重组。6.2、同源重组(homologous recombination)是指一般性重组,由两条通远去的 DNA 分子,通过配对、链断裂和再连接而产生的片段之间的交换过程。6.3、Holliday 模型:它是通过要发生重组的 2 个 DNA 分子的 2 条单链在同一部位断裂,断裂的游离末端彼此交换形成异源双链,然后 2 条杂合单链彼此连接形成 Holliday 连接体。是用来解释同源重组现象。6.4、转座子(transposon):是在基因组中可以移动的一段 DNA 序列。类型:插入序列(ins
5、ertion sequence,IS,简称 IS 因子) ,最简单的转座子;复合转座子,这类转座子中除了有转座酶基因外,还带有药物抗性基因(或其相关基因) ,因结构较大而复杂。6.5、复合型转座子与 IS 元件异同复合型转座子特点:(1)末端有反向重复序列,为转座酶所必须(2)中间有 ORF 作为标记基因(3)转座后,把位点大都成为正向重复序列。异同点:IS 元件较小,含一个转座酶基因,编码与转座有关的蛋白质;两侧为短的末端反向重复序列。复合型转座子:较大而复杂;含一个转座酶基因,基因末端为反向重复序列;中间含有标记基因、转为后,靶位点成正向重复序列。7.1、原核 RNA 转录的一般过程。7.
6、2、简述真核与原核生物基因转录的差异(1)原核只有一种 RNA 聚合酶,真核有三种(2)启动子结构不同,真核有三种不同的启动子和相关元件(3)真核RNApol 高度分工,核内三种 RNA 聚合酶分别转录不同类型的核基因(4)真核 RNApol 借助各种转录因子选择结合启动子,转录过程有很多蛋白因子参与(5)转录产物差别很大,原核的初始转录产物大多数都是编码序列,与蛋白质氨基酸序列成线性关系;真核,初始产物很长,有内含子,成熟的 mRNA 只占初始转录产物的一小部分。 (6)真核转录产物经历剪接,修饰的转录后加工成熟过程,原核初始转录产物基本无成熟过程,直接作为成熟 mRNA 行使翻译模板工功能
7、;原核生物的其他各类 RNA 仍以前体方式合成,然后加工为成熟的 rRNA,tRNA 等(7)原核:转录产物 mRNA 为多顺反子;大多数真核,mRNA 是单顺反子结构。 (8)原核:转录产物直接作为翻译模板,转录合成mRNA 的同时,蛋白质翻译也在进行。即原核转录 mRNA与蛋白翻译进行偶联。 (9)真核转录以正调控为主,原核调控正、负都有。 (10)真核 DNA 的顺式元件比原核复杂得。7.3、转录的不对称性是指在 RNA 的合成中,DNA 的二条链中仅有一条链可作为转录的模板,称为转录的不对称性。与 mRNA 序列相同的那条 DNA 链称为 编码连(encoding strand)/(非
8、模板链( non- template strand)/:非模链板与合成的 RNA 产物链从一个方向阅读时序列完全相同。/有义链(sense strand )/正链(Positive-strand);将另一条根据碱基互补原则指导 mRNA 合成的 DNA 链称为模板链(template strand):用于转录的链。 /反义链(anti-sense strand):复制出的互补链。 /负链(Negative strand)。7.4、TF(transcription factor,转录因子 ):真核生物 RNA聚合酶在转录过程中所需要的各种蛋白质因子。分为两类:通用转录因子(general tra
9、nscription ,GTF)和基因特性转录因子(gene specific transcription factor , )7.5、TBP(TATA 结合蛋白 )作用,TBP 是 PIC 的一部分,并在组建复合物过程中发挥组织作用;TBP 的特异性由与其相伴的 TAF 决定; TBP 是一种普通的对所有启动子都起作用的转录因子,而不要求启动子是否都具有 TATA 框。7.6、真核三种 RNA 聚合酶分别转录什么 RNA:RNA 聚合酶 I 转录产物为 rRNA,RNA 聚合酶 II 的产物负责 hmRNA或 mRNA 前体转录, RNA 聚合酶 III 负责 tRNA。8.1、核 mRNA
10、 前体内含子的剪接有哪几种:(1)自我剪接内含子(2)蛋白质参与剪接的内含子(3)依赖 snRNP 剪接的内含子。9.1、遗传密码的简并性:同一种氨基酸具有两个或更多个密码子的现象,主要变现在 mRNA 密码子的第三位碱基上。简并性的出现是由于 tRNA 反密码子的第一位碱基可以和mRNA 构成摆动碱基对。极性通常是由密码子的第二位碱基决定。9.2、反密码子:是位于 tRNA 反密码环中部、可与 mRNA中的三联体密码子形成碱基配对的三个相邻碱基。SD 序列:细菌的 mRNA 通常含有一段位于起始 AUG 序列上游 10nt 左右富有嘌呤碱基的区域。9.3、何谓信号肽?有哪些功能特点?信号肽(
11、signal peptide):是进入 ER 受体蛋白 N 端的一段疏水性肽段,其基因的 5端有一段 1632 个氨基酸肽段。功能特点:(1)几乎所有的信号肽都是疏水的(2)信号肽一般位于蛋白质的 N 端,进入膜后被信号肽酶水解(3)信号肽中部由 10-15 个残基构成疏水性核,这种核容易形成 螺旋,进而被折叠,这些机构对信号肽功能很重要。 (4)信号肽 C 端有一个能被信号肽酶识别的位点(5)将信号肽认为只是位于 N 端的一段疏水短肽是片面的(6)信号肽没有严格的专一性(7)信号肽还是一种环状结构。(起功能是在信号识别蛋白(SRP)和 SRP 受体等因子的协助下引导多肽链穿过 ER 膜进入腔
12、内) 。10.11、乳糖操纵子调控模型主要内容: Z、 Y、A 基因的产物由同一条多顺反子的 mRNA 分子所编码 这个 mRNA 分子的启动子紧接着操纵区(O 区) ,而位于阻遏基因 I 与操纵基因 O 之间的启动子区(P) ,不能单独起动合成 -半乳糖苷酶和透过酶的生理过程。 操纵基因是 DNA 上的一小段序列(仅为 26bp) ,是阻遏物的结合位点。 当阻遏物与操纵基因结合时,lac mRNA 的转录起始受到抑制。诱导物通过与阻遏物结合,改变它的三维构象,使之不能与操纵基因结合,从而激发 lac mRNA 的合成。当有诱导物存在时,操纵基因区没有被阻遏物占据,所以启动子能够顺利起始 mR
13、NA 的合成。10.12、色氨酸操纵子机制(1)阻遏蛋白的负调控:受其上游调控蛋白 R 基因的调控。R 并没有与 O 结合的活性,只有当环境能提供足够浓度的色氨酸时,R 与色氨酸结合后而活化,能够与 O 结合,阻遏结构基因的转录。 (2)弱化子及其作用:当色氨酸达到一定浓度,但还没有高到能够活化 R 使其起阻遏作用的程度时,产生色氨酸合成酶类的量已经明显降低,而且产生的酶量与色氨酸浓度呈负相关。这种调控现象与色氨酸操纵子特殊的结构有关。10.2、CAP(环腺苷酸受体蛋白) 是大肠杆菌分解代谢物基因活化蛋白,这种蛋白可将葡萄糖饥饿信号传递个许多操纵子,使细菌在缺乏葡萄糖时可以利用其他碳源,属于正调控。10.3、操纵子一般包括调节基因、启动子、操纵基因核仁结构基因等功能序列组成。10.4、 反式作用因子10.5、模体(motif)和结构域(domain )区别10.6、反式作用因子和 DNA 怎么结合的结构域:螺旋-转角-螺旋(HTH) 、螺旋-环- 螺旋(HLH) 、锌指(zinc finger)、亮氨酸拉链(ZIP)10.7、增强子(enhancer):是指能使与它连锁的基因(位于同一条 DNA 链上,但可远程作用)转录效率明显增加的DNA 序列。衰减子(attenuator ):因为转录终止发生在这一区域,并且这种终止能被调节,因此这个区域被称为衰减子。