1、谱系分析在生态学中的应用 原理、实例和实现金冬梅2012-12-dullduck_提纲 什么是谱系？ 谱系与生态学有什么关系？ 生态学中常用的谱系分析 谱系分析怎么做？谱系 phylogeny 谱系是 物种 （或类群） 间的进化关系，通常根据分子序列和表型的相似 性 或差异程度进行推断。 研究谱系的学科是谱系学 /系统学（ phylogenetics）其研究成果就是谱系。 生态学可以利用现有的系统学研究成果构建谱系树。Charles Darwin, 1859A phylogenetic tree of life, showing the relationship between species
2、, whose genomes have been mapped by humans. The APG III (2009) tree showing relationships of the orders of the angiosperms 根结点 (root)：该谱系树所包含的所有物种（或类群）的共同祖先 末端节点 (tip, terminals, leaf )：现存物种 中间结点 (node)： 表示分化事件，或其后代的最近共同祖先 枝 (branch)： 连接相邻两个结（节）点的线 分枝 (clade)：谱系树的一部分，包括由一个共同祖先衍生的所有后代读懂谱系树 branchnode
3、root tipevolutionary time 不带枝长： (C, D), B), A) root; 带枝长： (C: 2, D: 2): 1, B: 3): 1, A: 4) rootnotes;谱系树的表示 谱 系群落性状群落谱系结构群落构建性状保守性谱系 在 生态学 中的位置主 导 的生 态过 程 : 性状保守 性状 趋 同生境 过滤 (表型相似聚集 ) 聚集分布 均匀分布竞 争排斥 (表型相似相斥 ) 均匀分布 随机分布由性状保守性与主导生态过程的不同组合预测的群落物种组成在区域物种库中的谱系分布Webb et al. (2002) Annual Review of Ecology and SystematicsEmerson and Gillespie (2008) Trends in Ecology & Evolution生态学中常用的谱系分析 谱系多样性 (Phylogenetic diversity) 群落 谱系 结构 (Community structure) 性状保守性与性状间的相关性 (Trait analysis)
