1、生物信息学生物信息学Bioinformatics编号编号 名称名称 学时学时第一章第一章 生物信息学引论生物信息学引论 2第二章第二章 生物信息学的生物学基础生物信息学的生物学基础 2第三章第三章 生物信息学数据库资源及应用生物信息学数据库资源及应用 6第四章第四章 DNA和蛋白质序列分析和蛋白质序列分析 4第五章第五章 系统发生分析系统发生分析 4第六章第六章 基因组学与基因预测基因组学与基因预测 6第七章第七章 蛋白质结构域功能预测蛋白质结构域功能预测 4第八章第八章 电子克隆的原理和应用电子克隆的原理和应用 4Species PhylogenyOrangutan Gorilla Chim
2、panzee HumanFrom the Tree of the Life Website,University of ArizonaGlobal Phylogeny of Fully Sequenced OrganismsScience. 2006 ; 311(5765):1283-7Toward automatic reconstruction of a highly resolved tree of life 生物学家： We have a dream Tree of Life: 重建所有生物的进化历史并以系统树的形式加以描述梦想走进现实： How? 最理想的方法：化石！ 零散、不完整
3、比较形态学和比较生理学：确定大致的进化框架 细节存很多的争议比较形态学证据比较形态学证据(Comparative morphology)普适性普适性由 4种核酸组成 分子水平的进化表现为： DNA序列的演化、氨基酸序列演化、蛋白质结构的演化可比较性可比较性比较不同物种的有关 DNA序列 建立 DNA序列的演化模型、氨基酸序列的演化模型（数学模型）蛋白质结构的演化模型（形态、性状的演化模型？）基因组编码信息的丰富基因组编码信息的丰富与形态、性状包含的信息相比，基因组序列包含更多、更复杂的信息结构第三种方案 进化学的分子途径分子系统发育学分子系统发育学Molecular Phylogenetics分子系统学分子系统学Molecular SystematicsWhat can we do for molecular evolution?序列比较序列比较 ： 源于同一祖先 DNA/氨基酸序列的两条 DNA/氨基酸序列，考察二者的差异。序列差异序列差异 ： 进化过程中分子突变的痕迹分子进化分子进化 ：以累计在 DNA/氨基酸分子上的历史信息为基础，研究分子水平的生物进化过程和机制。分子系统学为生物分类问题提供了许多崭新的见解。
