1、http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed,PUBMED数据库,张士靖医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,一、PubMed简介,二、检索途径和方法,三、检索结果处理,四、其他辅助检索,主要内容,五、免费获取全文,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,一、PubMed简介,1.PubMed基本情况2.PubMed的由来3.PubMed的数据范围4.PubMed的特点5.PubMed主页,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,一、PubMed简介,1.PubMed基本情况PubMed是美国NLM所属的国家生物技术信息中心（NCBI）开发的一个以We
2、b方式向用户提供服务的生物医学文献检索系统，是继MEDLINE数据库国际联机检索和光盘检索之后推出的一种网络免费检索方式。,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,包括2,100多万篇来自MEDLINE和其他生命科学期刊的生物医学文献最早可回溯到1948年提供部分全文和其他相关资源的链接,一、PubMed简介,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,一、PubMed简介,2.PubMed的由来 创刊:最早可以追溯到1879年美国NLM编译出版的医学文献检索刊物医学索引（Index Medicus, IM）。,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,1964年:为了实现IM的自动化编辑出版，NL
3、M开发了“医学文献分析与检索系统”（Medical Literature Analysis and Retrieval System, 简称MEDLARS）.目前MEDLARS已拥有40多个数据库，其中最重要、最大、且发展最早的为MEDLINE(MEDLARS ON LINE) 生物医学数据库,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,1971年: MEDLINE正式建成联机数据库，并通过MEDLARS开展国际联机检索服务。自MEDLINE投入联机检索服务以来，一直成为MEDLARS最大的使用频率最高的数据库。,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,1983年：随着光盘技术的发展，MEDLIN
4、E光盘数据库建成，并得到了广泛的应用。1997年9月26日， MEDLINE网络版开通，取名PubMed，并向全球免费开放。,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,很多医务工作者宁可在每次检索时都花上成倍的时间，却不愿花上几个小时去认真研究一下PubMed。君欲善其事，必先利其器，PubMed就好像一把功能强大的枪，你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹，更重要的是，你要知道如何利用准星瞄准，如何把这把枪的功能发挥到及至。,一、PubMed简介,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,一、PubMed简介,出版商提供的书目信息,PreMedline,MEDLINE,与NCBI其它数据库
5、的链接,3.PubMed的数据范围,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,3.1 MEDLINE基本情况出版：美国国家医学图书馆（National Library of Medicine, NLM）。印刷版 1879联机版 1971光盘版 1983网络版 1997,MEDLINE数据库简介,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,MEDLINE数据库简介,收录范围：收录7538种（2009.10.11） 权威期刊，包含50种语言，涉及70多个国家（其中中国48种），约40万篇/年，已经累计2100余万篇。内容涉及生物医学各个领域；85%原文为英语。回溯年代：1948年至今每条记录标有inde
6、xed for MEDLIEN标记,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,内容涵盖三种重要的纸本医学文献检索工具：Index Medicus Index to dental Literature International Nursing Index,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,学科范围：基础生命科学临床生命科学 生物科学 解剖学组织学化学与药物心理学社会医学农业 医技设备学 医技工业学 医学信息学使用词表：MeSH（医学主题词表）,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,3.2 PreMEDLINE,是一种由正在加工处理中的文献记录组成的
7、数据库，这些新记录还未被标引，暂时存放在PreMEDLINE数据库中。每天更新，经过标引（增加主题词、文献类型、数据库存取号等字段）以后转入Medline，一旦记录被转入到Medline数据库，就被从PreMEDLINE数据库中删除。每条记录标有in Process标记。,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,Pre-Medline最新信息,Medline,New Data,Collect,PubMed,Process,PubMed,一周以后,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,（Publisher-Supplied Citation） 出版商直接向PubMed提供的非Medline收录
8、的电子刊物，每条记录标有 as supplied by publishers标记。（如：Science或Nature中的地质学文献等）。,3.3出版商提供的书目信息,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,标记不同，其数据来源亦不同,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,3.4与NCBI其它数据库的链接,Nucleotide：DNA序列数据库Protein：蛋白质序列数据库Genome：基因组序列数据库Structure：分子结构模型数据库OMIM：人类孟德尔遗传学在线数据库PMC: PubMed中心，免费全文期刊检索,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,与NCBI其它数据库的链接,华中
9、科技大学同济医学院医药卫生管理学院,3.特点收录生物医学权威期刊最多 世界上70多个国家的7000多种权威期刊多种检索方法，多条检索途径时效性极强(每周更新)回溯年代久远（1948年至今）利用MeSH作为转换词表，标引质量高部分文献可以免费获取全文检全率、检准率高,PubMed简介,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,4、PubMed主页网址：http:/www. nlm.nih.gov,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,简介,基本检索,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,PubMed简介,PubMed comprises more tha
10、n 21 million citations for biomedical literature from MEDLINE, life science journals, and online books. Citations may include links to full-text content from PubMed Central and publisher web sites.,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,一、PubMed简介,二、检索途径和方法,三、检索结果处理,四、其他辅助检索,主要内容,五、免费获取全文,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,1、基本检索 2、
11、高级检索 3、主题词检索,二、检索途径和方法,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,1.基本检索,MeSH转换表（词语检索及自动词语匹配）期刊转换表短语表作者姓名索引逻辑运算符检索,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,Pubmed基本检索实例例一 “肝癌和肝炎的关系” “liver cancer ” 和 “hepatitis”第一步 选择关键词 输入检索框 liver cancer hepatitis,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,1.基本检索,检索前，选择需查询数据库。下拉菜单中显示Entrez系统提供的所有数据库，可任意选择进行检索。
12、,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,可看到该检索词下命中的所有文章、综述及免费全文,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,Combined Functional Genome Survey of Therapeutic Targets for Hepatocellular Carcinoma.Satow R, Shitashige M, Kanai Y, Takeshita F, Ojima H, Jigami T, Honda K, Kosuge T, Ochiya T, Hirohashi S, Yamada T.Clin Cancer Re
13、s. 2010 Apr 13. Epub ahead of printPMID: 20388846 PubMed - as supplied by publisherRelated citations,这条记录包含几个字段?,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,文摘格式,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,注意检索词的使用,截词检索 当检索词结尾不确定时,可用 * 替代精确检索 用双引号“ ”将要检索的多个词限定为一个词进行检索,看下面的例子!,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,截词检索和字段限定检索,例如：输入cell*ti可以查出标题中含cell、cells、cellifer
14、ous、cellophane和cellular等词的文献。,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,“ ”将短语做为不可分割的整体进行检索。如：“oxygen free radicals”注意：“ ”必须为英文半角状态下输入,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,1、基本检索 2、高级检索 3、主题词检索,二、检索途径和方法,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,2.高级检索,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,高级检索界面下可进行多种检索条件的限定。同时可显示检索历史，允许使用检索史序号进行组配检索。,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,检索框,检索史,限定检索,30个字段,可选
15、择作者、刊名、出版日期等多个项目进行任意组合检索 。如果输入框不够，可点击“Add More Fields”添加,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,限定检索,字段限定检索,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,高级检索限定检索,设定只搜索包含摘要、全文或免费全文的文献在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围内搜索只搜索某语种出版的文献或特定的文章类型只搜索PubMed数据库的某一子数据库只在某一特定的字段中搜索，缺省是所有字段,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,Eg.检索2002年以来发表在Nature杂志上关于糖尿病（diabetes）的英文文献，要求能获得免费全文,限制检索案
16、例,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,检索框输入检索词,对应字段名称填写期刊名称和时间范围,限定只链接到可免费获取的全文,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,限定语种为英文,最后点击检索输入框后的Search,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,13篇。大大减少了文献数量,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,高级检索检索史（ Search History ）,当至少运行一次检索后，即可使用History检索史中显示的是你前面所做的查询方案和查询结果（检索序号、检索式、检索时间和检索结果数量） 注:1、检索史中最多可保留100个检索式，超过100个时将自动删除最早的检索式。 2
17、、系统在休止状态对检索式的保留时间为8小时，8小时后检索式自动消失。,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,详细检索策略（Details）,主要用于描述所输入检索式的详细检索过程，即系统将用户所输入的检索词自动转换为哪些词（如MeSH词等），并使用什么样的句法（检索规则）来进行检索。同时也包含了任何的错误信息。,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,系统将输入的检索词与MeSH转换表进行对照,自动按照转换后的检索式进行组配和检索.,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,1、基本检索 2、高级检索 3、主题词检
18、索,二、PubMed的检索途径和方法,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,3、主题检索,主题词检索,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,3、主题检索,单篇/多篇引文匹配 临床咨询专题咨询,主题词检索 期刊检索临床实验外部链接,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,3、主题词检索（MeSH Database）,主题词数据库（MeSH Database）在“MeSH Database”检索提问框内输入检索词后系统将自动主题词表进行匹配检索，有的非主题词将转换为主题词，可浏览主题词的定义、浏览树状结构并进行选择，并能提供可供组配的副主题词进行检索，还提供是否只针对主要主题词检索及是否进行扩
19、展检索等功能,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,MeSH Database：例：从主题途径查找 FK506副作用和肾移植的文献,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,主题词轮排,提示相关词,主题词轮排表,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,主题词细节屏,主题词词义注释,主题词细节屏,副主题词选择,主题词词义注释,不扩展检索,加权检索,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,曾用词,药理作用,树状结构,曾用词,入口词,树状结构,药理作用,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,选择发送方式Search B
20、ox with ANDSearch Box with ORSearch Box with NOT,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,search box,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,题录格式界面,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,一、PubMed简介,二、检索途径和方法,三、检索结果处理,四、其他辅助检索,主要内容,五、免费获取全文,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,三、检索结果处理,1、检索结果的显示与标记 2、检索结果的保存及定购,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,检索结果显
21、示默认为题录格式每页显示20条记录,结果显示格式,每页显示记录数,结果排序方式,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,纯文本方式显示,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,纯文本显示记录,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,文摘显示格式,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,MEDLINE格式,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,可链接到SpringerLink数据库获取全文 ，但是是收费的,可链接到PubMed中心获取免费全文,全文链接图标,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,剪切板静止状态下最长保存8小时，最多可以保存500条记录,
22、华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,以邮件方式发送记录,填写邮箱地址,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,一、PubMed简介,二、检索途径和方法,三、检索结果处理,四、其他辅助检索,主要内容,五、免费获取全文,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,四、其他辅助检索,PubMed Service期刊数据库(Journal Database) 单篇引文匹配器（Single Citation Matcher）多篇引文匹配器（Batch Citation Matcher）临床咨询（Clinical Queries）我的NCBI （My NCBI ）,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,
23、Journal Database (期刊数据库),华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,Journal Database (期刊数据库),Journal Database (期刊数据库) 可输入刊名全称、缩写或国际标准期刊号（ISSN)检索特定期刊的编目信息； 可通过 links to full-text websites 链接进入所有与PubMed建立链接的生物医学期刊列表；,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,检索： PubMed中收录关于高血压(hypertension)的期刊有哪些？,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,单篇引文匹配器,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,
24、单篇引文匹配器,输入刊名、日期、卷、期、页码、作者、题目中的一项或多项内容进行检索，系统返回文献记录结果,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,单篇引文匹配器,例：引文匹配器（Single Citation Matcher） nursing，2008，38（12）：61,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,Clinical Queries（临床咨询）,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,Clinical Queries（临床咨询）,应用Clinical Queries（临床提问）检索循证医学文献：1、列有临床医生常用的类目，如therapy（治疗）、Diagnosis（诊断）、eti
25、ology（病因）和prognosis（预后）2、可以用来检索临床实践过程中遇到的一些具体问题，如系统评价、Mete分析、临床试验、循证医学、实践指导以及有关遗传学方面的问题等,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,Clinical Queries（临床咨询）,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,Clinical Queries（临床咨询）,检索有关“高血压合并糖尿病的诊断”,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,一、PubMed简介,二、检索途径和方法,三、检索结果处理,四、其他辅助检索,主要内容,五、免费获取全文,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,五、免费获取原文（Open
26、Access）在PubMed有约5%的期刊 ，可以免费浏览到全文。（1）通过自由词直接查找全文（2）通过期刊列表查找全文,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,Full text 格式,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,PDF 格式,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,Advanced search,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,January 19, 2011,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,Thank You !,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院,
