知识发现工具SciFinder入门.pptx

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资源描述

1、杨眉高分子化学,知识发现工具SciFinder入门,谁能读这么多? 谁需要读这么多? 发现与创新是不是一个数字的游戏?,“首先必需认识到,科研工作者都十分宝贵自己的时间,除极少数和自己工作关系十分密切的论文以外,绝大多数读者都不会阅读全文。”- 邹承鲁 “我的科学之路”,2003年10月,序言:为什么我们需要知识发现工具?,内容纲要,12/04/2014,3,SciFinder的前世今生,12/04/2014,4,SciFinder的前世今生,12/04/2014,5,SciFinder与CA(CD/Print)的区别,SciFinder的前世今生,12/04/2014,6,覆盖多个学科传统化

2、学有机化学、高分子、应用化学和化学工程、物理化学、无机化学和分析化学。生命科学遗传学, 基因组学, 酶学, 蛋白质组学, 实验内科学, 生物化学, 生物技术学, 分子生物学, 微生物学, 细胞生物学 ,药理学等,SciFinder的前世今生,数据多元化CA(1907-)Medline医学库专利全文(欧洲、美国等61家机构授权)180多国的文献50多个语种,12/04/2014,7,SciFinder的前世今生,12/04/2014,8,SciFinder涵盖了化学相关领域超过98%的文献,溶剂,催化剂,产率等,SciFinder的前世今生,SciFinder内容模块,12/04/2014,9,

3、SciFinder知识发现途径,文献检索(References)CAPLUSSM 文摘数据库Medline National Library of Medicine数据库物质检索(Substances)CAS REGISTRYSM 物质数据库CHEMCATS-商业来源数据库CHEMLIST-管制数据库反应检索(Reaction)CASREACT 化学反应数据库,12/04/2014,10,SciFinder知识发现途径,12/04/2014,11,SciFinder知识发现途径,知识发现目标:获得不知道的信息知识发现过程,12/04/2014,12,SciFinder初体验,SciFinder

4、 Web的系统要求Windows用户支持IE 7.x或者FireFox 2.xMac 用户支持 Firefox 和 Safari首次需注册ORJava 安装(初次画分子结构时提示)信息来源:图书馆主页,12/04/2014,13,SciFinder初体验,通过图书馆主页获取相关信息,12/04/2014,14,SciFinder初体验,进入数据库介绍页面,12/04/2014,15,SciFinder初体验,进入数据库介绍页面,12/04/2014,16,SciFinder初体验,进入数据库介绍页面,12/04/2014,17,SciFinder初体验,数据库注册,12/04/2014,18,

5、SciFinder初体验,数据库注册,12/04/2014,19,SciFinder初体验,数据库注册,12/04/2014,20,交大邮箱医学院邮箱,便于找回密码,SciFinder初体验,数据库注册,12/04/2014,21,通过链接确认,SciFinder初体验,数据库登录(http:/scifinder.cas.org),12/04/2014,22,SciFinder初体验,数据库主界面,12/04/2014,23,保存过的结果集,邮件提醒结果集,3个主要检索入口及检索选项,对多个检索式进行逻辑运算,实战演练,文献检索主题检索例1: 纳米材料在药物领域的研究物质检索标示符检索例2:

6、紫杉醇的生物活性及靶点分析结构式检索例3: 结构检索反应检索官能团检索例4: 由酰卤化物生成醛的反应,12/04/2014,24,实战演练:文献检索,例1: 纳米材料在药物领域的研究策略制定nanostructured materials of pharmaceuticals检索结果,12/04/2014,25,实战演练:文献检索,例1: 纳米材料在药物领域的研究结果分析与精炼,12/04/2014,26,实战演练:文献检索,例1: 纳米材料在药物领域的研究结果分析与精炼,12/04/2014,27,实战演练:文献检索,例1: 纳米材料在药物领域的研究结果分析与精炼,12/04/2014,28

7、,一共12种分析方式,一共6种精炼途径,实战演练:文献检索,例1: 纳米材料在药物领域的研究结果分析与精炼,12/04/2014,29,12/04/2014,30,实战演练:文献检索,例1: 纳米材料在药物领域的研究结果分析与精炼,12/04/2014,31,实战演练:文献检索,例1: 纳米材料在药物领域的研究结果分析与精炼,12/04/2014,32,实战演练:文献检索,例1: 纳米材料在药物领域的研究结果分析与精炼,12/04/2014,33,实战演练:文献检索,例1: 纳米材料在药物领域的研究结果分析与精炼,12/04/2014,34,实战演练:文献检索,例1: 纳米材料在药物领域的研究

8、结果分析与精炼,12/04/2014,35,实战演练:文献检索,例1: 纳米材料在药物领域的研究结果分析与精炼,文献类型,内容分类,实战演练:文献检索小结,构建主题检索策略以介词连接主要检索词能够自动识别同义词,近义词,缩写,并有截词,断词等功能选择恰当的结果集合使用分析精炼功能缩小范围学会Analyze/Refine功能的组合使用使用Categorize自动分类通过跳转获取更多信息可实现从文献到物质,反应,引文的跳转,12/04/2014,36,实战演练:物质检索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶点分析baidu获取物质信息紫杉醇: Paclitaxel , TAXOLCAS No: 33069

9、-62-4,12/04/2014,37,实战演练:物质检索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶点分析检索获得物质详细信息,12/04/2014,38,检索框,可输入物质学名、俗名、CAS No等信息,实战演练:物质检索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶点分析检索获得物质详细信息,12/04/2014,39,实战演练:物质检索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶点分析查看生物活性,12/04/2014,40,实战演练:物质检索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶点分析查看靶点,12/04/2014,41,实战演练:物质检索,例3:结构检索精确结构检索亚结构检索相似结构检索Markush检索,12/04/2014,42

10、,实战演练:物质检索,例3: 结构检索,12/04/2014,43,画图版,用于输入结构式,实战演练:物质检索,不需要安装JAVA的结构编辑器,12/04/2014,44,实战演练:物质检索,需要安装JAVA的结构编辑器,12/04/2014,45,输入物质信息获取结构式,实战演练:物质检索,例3:结构检索精确结构检索绘制结构式,12/04/2014,46,实战演练:物质检索,例3:结构检索精确结构检索选择立体构型匹配度,12/04/2014,47,实战演练:物质检索,例3:结构检索精确结构检索得到物质的盐、聚合物、混合物或者配合物等等,12/04/2014,48,实战演练:物质检索,例3:结

11、构检索亚结构检索,12/04/2014,49,33069-62-4,实战演练:物质检索,例3:结构检索亚结构检索,12/04/2014,50,实战演练:物质检索,例3:结构检索亚结构检索得到物质的所有修饰信息1547条,12/04/2014,51,实战演练:物质检索,例3:结构检索亚结构检索分析与精炼,12/04/2014,52,八大限定结构再次限定同位素限定金属包含限定商业化限定可提供性质限定性质数据限定可提供参考限定原子附属性限定,六大分析生物活性分析商业化分析元素分析反应可行性分析物质角色分析靶点分析,实战演练:物质检索,例3:结构检索相似结构检索,12/04/2014,53,实战演练:

12、物质检索,例3:结构检索相似结构检索,12/04/2014,54,实战演练:物质检索,例3:结构检索相似结构检索,12/04/2014,55,实战演练:物质检索,例3:结构检索相似结构检索,12/04/2014,56,实战演练:物质检索,例3:结构检索Markush结构检索特定物质Specific Substance 以特定化学结构所陈述的特定物质,会被标示CAS No.预测性物质Prophetic Substance不会被标示CAS No. 一个Markush可以陈述上百或上千的化学物质找到其他途径无法检索到的专利帮助进行初步的专利评估,12/04/2014,57,实战演练:物质检索,例3:

13、结构检索Markush结构检索,12/04/2014,58,实战演练:物质检索,例3:结构检索Markush结构检索,12/04/2014,59,实战演练:物质检索,例3:结构检索Markush结构检索,12/04/2014,60,实战演练:物质检索,例3:结构检索Markush结构检索,12/04/2014,61,实战演练:结构检索小结,精确结构检索:结果包含盐和混合物等,母体结构不能修改,不能修饰亚结构检索:结构必须存在,母体结构不能修改,但可以被修饰相似结构检索:母体结构可修改可被修饰,给出相似度Markush检索:获得专利文献中的预测性物质,12/04/2014,62,实战演练:反应检

14、索,例4: 由酰卤化物生成醛的反应,12/04/2014,63,实战演练:反应检索,例4: 由酰卤化物生成醛的反应acid halide aldehyde,12/04/2014,64,实战演练:反应检索,例4: 由酰卤化物生成醛的反应,12/04/2014,65,实战演练:反应检索,例4: 由酰卤化物生成醛的反应,12/04/2014,66,实战演练:反应检索,例4: 由酰卤化物生成醛的反应,12/04/2014,67,实战演练:反应检索,例4: 由酰卤化物生成醛的反应分析与精炼,12/04/2014,68,实战演练:反应检索,例4: 由酰卤化物生成醛的反应产率70%的反应,12/04/201

15、4,69,实战演练:反应检索,例4: 由酰卤化物生成醛的反应以Pd为催化剂的反应,12/04/2014,70,实战演练:反应检索小结,官能团反应适用于只涉及基团之间变化的反应,可获得更多参考信息多用Analyze/Refine,来获得催化剂,溶剂,产率等信息当无法找到具体反应,或者检索结果并不满意,尝试用亚结构反应查 询,可以获得更多的参考信息,12/04/2014,71,课程小结与习题,全面检索,避免漏检数据库后台支持多级精炼,层层筛选组合运用精炼、分析等多种后处理功能不断修正策略与结构找不到反应,或检索结果不尽如人意时,12/04/2014,72,课程小结与习题,更多参考信息iGroup(http:/ 021-64453167小木虫论坛(http:/ 出数据库中的具体名称。习题2:如何检索青蒿素的合成方法? 2种及以上途径可获加分。附加题:你了解SciFinder的特殊功能么?举1个例子即可获得加分!提示:请提交完整的过程信息提交邮箱:,12/04/2014,74,12/04/2014,75,

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