王镜岩生物化学氨基酸与蛋白质.ppt

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资源描述

1、2018/7/15,1,第三章 蛋白质,2018/7/15,2,蛋白质是由20种L-型氨基酸组成的长链分子。,第一节 蛋白质概论,一、 蛋白质的化学组成与分类,1、元素组成,碳 50% 氢7% 氧23% 氮16% 硫 0-3% 微量的磷、铁、铜、碘、锌、钼,凯氏定氮:粗蛋白质含量=蛋白氮6.25,2、 氨基酸组成,2018/7/15,3,酶、运输蛋白、营养和贮存蛋白、激素、受体蛋白、运动蛋白、结构蛋白、防御蛋白。,3、分类,(1) 按组成,简单蛋白 结合蛋白,(2)按分子外形的对称程度,球状蛋白质 纤维状蛋白质 膜蛋白质,(3)按功能,2018/7/15,4,蛋白质分子量 = 氨基酸数目*11

2、0,二、蛋白质的大小与形状,少于50个氨基酸的低分子量氨基酸多聚物称为肽,寡肽或生物活性肽、多肽。,多于50个氨基酸的称为蛋白质。,110=氨基酸残基的平均分子量(P160),2018/7/15,5,四级结构:亚基之间的聚集形式,三、蛋白质分子的构象与结构层次,蛋白质都有自己特有的天然空间结构,称为构象。,一级结构:氨基酸顺序,二级结构:-螺旋、-折叠、-转角,无规卷曲,三级结构:整个肽链(亚基)的形状,2018/7/15,6,1 酶 2结构成分(结缔组织的胶原蛋白、血管和皮肤的弹性蛋白、膜蛋白)3贮藏(卵清蛋白、种子蛋白)4物质运输(血红蛋白、Na+-K+-ATPase、葡萄糖运输载体、脂蛋

3、白、电子传递体)5细胞运动(肌肉收缩的肌球蛋白、肌动蛋白)6激素功能(胰岛素)7自我保护(抗体、皮肤的角蛋白、血凝蛋白8接受、传递信息(受体蛋白,味觉蛋白)9调节、控制细胞生长、分化、和遗传信息的表达(组蛋白、阻遏蛋白),四、 蛋白质功能的多样性,2018/7/15,7,第二节 氨基酸,四大类生物分子中,蛋白质是生物功能的主要载体,而氨基酸是蛋白质的构件分子。,自然界中存在的成千上万种蛋白质,在结构和功能上的惊人的多样性归根结底是由20中常见的氨基酸的内在性质造成的。,这些性质包括:,聚合能力,酸碱性,侧链结构的多样性,化学功能的多样性,2018/7/15,8,一、蛋白质的水解,酸水解:色氨酸

4、破坏,天冬酰胺、谷胺酰胺脱酰胺基,碱水解:消旋,色氨酸稳定,酶水解:水解位点特异,用于一级结构分析,肽谱,2018/7/15,9,非蛋白质氨基酸:存在于生物体内但不组成蛋白质 (约150种),二、氨基酸的结构与分类,基本氨基酸(编码的蛋白质氨基酸):组成蛋白质,20种,稀有氨基酸:是多肽合成后由基本氨基酸经酶促修饰而来,重点,2018/7/15,10,-氨基酸的一般结构,-氨基酸,与羧基相邻的-碳原子(C)上有一个氨基的氨基酸。,COO-,-C-,R,H3N,可变的侧链,H,2018/7/15,11,(1)R为脂肪烃基的氨基酸(5种),(一)基本氨基酸(编码的蛋白质氨基酸,20种),1、按照R

5、基的化学结构分类,2018/7/15,12,Gly是唯一不含手性碳原子的氨基酸,因此不具旋光性 从Gly至Ile,R基团疏水性增加,特点,R基均为中性烷基,R基对分子酸碱性影响很小,它们几乎有相同的等电点。(6 .00.03),2018/7/15,13,(2) R中含有羟基和硫的氨基酸(共4种),2018/7/15,14, Ser的-CH2OH基(pKa=15)在生理条件下不解离,但在大多数酶的活性中心都发现有Ser残基存在。 Ser和Thr的-OH往往与糖链相连,形成糖蛋白。 Cys的R中含巯基(-SH),具有两个重要性质: (1)在较高pH值条件,巯基离解。 (2)两个Cys的巯基氧化生成

6、二硫键,生成胱氨酸。 Met在生物合成中是一种重要的甲基供体。,特点,2018/7/15,15,(3)R中含有酰胺基团(2种),酰胺基中氨基易发生氨基转移反应,2018/7/15,16,(4)R中含有酸性基团(2种) Asp、Glu,Asp侧链羧基pKa为3.86,Glu侧链羧基pKa为4.25 它们是唯一在生理条件下带有负电荷的的两个氨基酸,2018/7/15,17,(5)R中含碱性基团(3种),2018/7/15,18, Lys侧链氨基的pKa为10.53,生理条件下,Lys侧链带有一个正电荷(NH3+),侧链的氨基反应活性增大。 Arg是碱性最强的氨基酸,侧链上的胍基是已知碱性最强的有机

7、碱,pKa值为12.48,生理条件下完全质子化。 His是pKa值最接近生理pH值的一种(游离氨基酸中为6.00,在多肽链中为7.35 ) ,是在生理pH条件下唯一具有缓冲能力的氨基酸。 His在酶的酸碱催化机制中起重要作用,特点,2018/7/15,19,在280nm处,Trp吸收最强,Tyr次之,Phe最弱。,(6) 芳香族氨基酸(苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸),苯丙氨酸(Phe,F),酪氨酸(Tyr,Y),色氨酸(Trp,W),2018/7/15,20,(7)、杂环族氨基酸(2种),Pro的-亚氨基是环的一部分,因此具有特殊的刚性结构。一般出现在两段-螺旋之间的转角处,Pro残基所在的位置必

8、然发生骨架方向的变化,,2018/7/15,21,婴儿期:Arg(精氨酸)和His(组氨酸)供给不足, 属半必需氨基酸。,u必需氨基酸u,成年人:Thr 苏氨酸 Val 缬氨酸 Leu 亮氨酸 Ile 异亮氨酸 Phe 苯丙氨酸 Trp 色氨酸 Lys 赖氨酸 Met 甲硫氨酸,携(缬氨酸)一(异亮氨酸)两(亮氨酸)本(苯丙氨酸)单(蛋氨酸,即甲硫氨酸)色(色氨酸)书(苏氨酸)来(赖氨酸)。 携(写)一两本单色书来;一两色素本来淡些;假设来写一两本书,(一)赖氨酸(Lysine):促进大脑发育,是肝及胆的组成成分,能促进脂肪代谢,调节松果腺、乳腺、黄体及卵巢,防止细胞退化;(二)色氨酸(Try

9、ptophane):促进胃液及胰液的产生;(三)苯丙氨酸(Phenylalanine):参与消除肾及膀胱功能的损耗;(四)蛋氨酸(又叫甲硫氨酸)(Methionine);参与组成血红蛋白、组织与血清,有促进脾脏、胰脏及淋巴的功能;(五)苏氨酸(Threonine):有转变某些氨基酸达到平衡的功能;(六)异亮氨酸(Isoleucine):参与胸腺、脾脏及脑下腺的调节以及代谢;脑下腺属总司令部作用于甲状腺、性腺;(七)亮氨酸(Leucine):作用平衡异亮氨酸;(八)缬氨酸(Viline):作用于黄体、乳腺及卵巢。(九)组氨酸(Hlstidine):作用于代谢的调节;,2018/7/15,22,2

10、018/7/15,23,在维持蛋白质的三维结构中起着重要(蛋白质的疏水核心)。,(1)非极性氨基酸 9种,这类氨基酸的侧链都能与水形成氢键,因此很容易溶于水,(2) 不带电何的极性氨基酸 6种,(3)带负电荷的氨基酸(酸性氨基酸) 2种,(4)带正电荷的氨基酸(碱性氨基酸) 3种,2018/7/15,24,非极性氨基酸,在维持蛋白质的三维结构中起着重要作用(蛋白质的疏水核心)。,2018/7/15,25,2018/7/15,26,不带电荷的极性氨基酸,这类氨基酸的侧链都能与水形成氢键,因此很容易溶于水。,2018/7/15,27,带负电荷的氨基酸(酸性氨基酸),2018/7/15,28,带正电

11、荷的氨基酸(碱性氨基酸),2018/7/15,29,胶原蛋白中的Lys侧链氧化时能形成很强的分子间(内)交联。,Arg的侧链碱性很强,与NaOH相当。,His是一个弱碱,是天然的缓冲剂,往往存在于许多酶的活性中心。,非极性氨基酸一般形成蛋白质的疏水核心,带电荷的氨基酸和极性氨基酸位于表面。,酶的活性中心:His、Ser、Cys,2018/7/15,30,(二) 非编码的蛋白质氨基酸,也称修饰氨基酸,是在蛋白质合成后,由基本氨基酸修饰而来。,(1)4-羟脯氨酸 (2)5-羟赖氨酸 这两种氨基酸主要存在于结缔组织的纤维状蛋白中。(3)6-N-甲基赖氨酸 存在于肌球蛋白中 (4)-羧基谷氨酸 存在于凝血酶原及某些具有结合Ca2+离子功能的蛋白质中。(5)Tyr的衍生物:3.5 -二碘酪氨酸、甲状腺素 存在于甲状腺蛋白中(6)锁链素由4个Lys组成 存在于弹性蛋白中,2018/7/15,31,

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