氨基酸密码子对照表.doc

上传人:j****9 文档编号:2215554 上传时间:2019-05-02 格式:DOC 页数:6 大小:199KB
下载 相关 举报
氨基酸密码子对照表.doc_第1页
第1页 / 共6页
氨基酸密码子对照表.doc_第2页
第2页 / 共6页
氨基酸密码子对照表.doc_第3页
第3页 / 共6页
氨基酸密码子对照表.doc_第4页
第4页 / 共6页
氨基酸密码子对照表.doc_第5页
第5页 / 共6页
点击查看更多>>
资源描述

1、与核苷酸序列相关的特征关键词表丙氨酸 Alanine A 或 Ala 89.079 CH 3 - 脂肪族类精氨酸 Arginine R 或 Arg 174.188 HN=C(NH 2 )-NH-(CH 2 ) 3 - 碱性氨基酸类天冬酰胺 Asparagine N 或 Asn 132.104 H 2 N-CO-CH 2 - 酰胺类天冬氨酸 Aspartic acid D 或 Asp 133.089 HOOC-CH 2 - 酸性氨基酸类半胱氨酸 Cysteine C 或 Cys 121.145 HS-CH 2 - 含硫类谷氨酰胺 Glutamine Q 或 Gln 146.131 H 2 N-C

2、O-(CH 2 ) 2 - 酰胺类谷氨酸 Glutamic acid E 或 Glu 147.116 HOOC-(CH 2 ) 2 - 酸性氨基酸类甘氨酸 Glycine G 或 Gly 75.052 H- 脂肪族类组氨酸 Histidine H 或 His 155.141 N=CH-NH-CH=C-CH 2 -|_| 碱性氨基酸类异亮氨酸 Isoleucine I 或 Ile 131.160 CH 3 -CH 2 -CH(CH 3 )- 脂肪族类亮氨酸 Leucine L 或 Leu 131.160 (CH 3 ) 2 -CH-CH 2 - 脂肪族类赖氨酸 Lysine K 或 Lys 14

3、6.17 H 2 N-(CH 2 ) 4 - 碱性氨基酸类蛋氨酸 Methionine M 或 Met 149.199 CH 3 -S-(CH 2 ) 2 - 含硫类苯丙氨酸 Phenylalanine F 或 Phe 165.177 Phenyl-CH 2 - 芳香族类脯氨酸 Proline P 或 Pro 115.117 -N-(CH 2 ) 3 -CH-|_| 亚氨基酸丝氨酸 Serine S 或 Ser 105.078 HO-CH 2 - 羟基类苏氨酸 Threonine T 或 Thr 119.105 CH 3 -CH(OH)- 羟基类色氨酸 Tryptophan W 或 Trp 2

4、04.213 Phenyl-NH-CH=C-CH 2 -|_| 芳香族类酪氨酸 Tyrosine Y 或 Tyr 181.176 4-OH-Phenyl-CH 2 - 芳香族类缬氨酸 Valine V 或 Val 117.133 CH 3 -CH(CH 2 )- 脂肪族类关键词 说明allele相关的个体或菌株含有相同基因的稳定的其它形式,该形式区别于这一位置的现有的序列(和或许其它序列)attenuator存在调节转录的终止的 DNA区域,它控制了一些细菌操纵子的表达; (2)位于启动子和第一个结构基因之间,引起转录的部分终止的序列区段C_region免疫球蛋白轻和重链的恒定区,和 T-细胞

5、受体 ,和 链;根据特定的链可包括一个或多个外显子CAAT_signalCAAT盒;位于可能参与 RNA聚合酶结合的真核生物转录单位的起始点的 75bp上游的保守序列的一部分;共有序列GG(C 或 T)CAATCTCDS 编码序列;对应于蛋白质中的氨基酸序列的核苷酸的序列(位置包括终止密码子);特征包括氨基酸概念上的翻译Conflict 在这一位点或区域,单独确定的“相同”序列有所不同D-loop 置换环;线粒体 DNA内的一个区域,其中 RNA的短的序列与 DNA的一条链配对,代替了这一区域的原始配对 DNA链;也用于说明在 RecA蛋白质催化的反应中,侵入的单链替代双链 DNA的一条链的区

6、域D-segment 免疫球蛋白重链的多变区,和 T-细胞受体的 链Enhancer 顺式-作用序列,它增强了(一些)真核生物启动子的作用,并能在任一方向和与启动子相关的任何位置处 (上游或下游)起作用Exon 编码剪接 mRNA部分的基因组区域;可以含有 5UTR,所有 CDS,和 3UTRGC_signalGC盒;位于真核生物转录单位起始点上游的保守的富含 GC区域,可以以多重拷贝或任一方向存在;共有序列=GGGCGGgene 鉴定为基因的生物学意义的区域,并已经指定名称iDNA 间插 DNA;通过几种重组中的任何一种能被消除的 DNAintron 被转录的 DNA区段,但通过同时剪接位于

7、其两侧的序列(外显子)即可从转录本内部将其除去J_segment 免疫球蛋白轻链和重链的连接区段,和 T-细胞受体 , 和 链LTR 长的末端重复,在确定序列的两端直接重复的序列, 类型典型地见于逆转录病毒中mat_peptide成熟的肽或蛋白质的编码序列;翻译后修饰之后成熟的或最终的肽或蛋白质产物的编码序列;位置不包括终止密码子(与相应的 CDS不同)misc_binding不能用任何其它 Binding关键词(primer_bind 或 protein_bind)表述的与另一个组成成分共价或非-共价结合的核酸中的位点misc_difference特征序列与记载中存在的有所不同,并且不能用任

8、何其它不同关键词(conflict,unsure,old_sequence,mutation,variation,allele或modified_base)表述misc_feature不能用任何其它的特征关键词表述的具有生物学意义的区域;新的或少见的特征misc_recomb任何一般性的,位点特异性的或复制的重组事件的位点,该位点中有不能用其它重组关键词(iDNA 和 virion)或来源关键词的修饰词(/transposon,/proviral)表述的双螺旋 DNA的断裂和愈合misc_RNA 不能用其他 RNA关键词(prim_transcript,precursor_RNA,mRNA,5

9、clip,3clip,5UTR,3UTR,exon,CDS,sig_peptide,transit_ _peptide,mat_peptide,intron,polyA_site,rRNA,tRNA,scRNA和 snRNA)限定的任何转录本或 RNA产物misc_signal含有控制或改变基因功能或表达之信号的任何区域,所述信号不能用其他Signal关键词(promoter,CAAT_signal,TATA_signal,-35_signal,10_signal,GC_signal,RBS,polyA_signal,enhancer,attenuator,terminator,和 rep_o

10、rigin)表述misc_structure不能用其他 Structure关键词(stem_loop 和 D-loop)表述的任何二级或三级结构或构象modified_base被指示的核苷酸是经修饰的核苷酸,并应由被指示的分子(在 mod_base修饰词意义中给出)所取代mRNA 信使 RNA;包括 5非翻译区(5UTR),编码序列(CDS,外显子)和非翻译区(UTR)mutation 在此位置处,相关品系的序列中具有突然的,可遗传的变化N_region 在重排的免疫球蛋白区段之间插入的额外的核苷酸Old_sequence在此位置处,所表述的序列修改了此序列以前的版本PolyA_signal聚

11、腺苷酸化之后内切核酸酶裂解 RNA转录本所必需的识别区域;共有序列AATAAAPolyA_siteRNA转录本上的位点,通过转录后聚腺苷酸化该位点将被加上腺嘌呤残基Precursor_RNA仍不是成熟的 RNA产物的任何 RNA种类;可包括 5剪切区(5clip),5非翻译区(5UTR),编码序列(CDS,外显子),间插序列(内含子) ,3非翻译区(3UTR),和 3剪切区(3clip)prim_transcript初级(最初的,未加工的)转录本;包括剪切区(clip),非翻译区(UTR),编码序列(CDS,外显子),间插序列(内含子),3非翻译区(3UTR)和3剪切区(3clip)prim_

12、bind 起始复制,转录或逆转录的非共价的引物结合位点;包括合成的例如 PCR引物元件的位点Promoter 参与 RNA聚合酶的结合以启动转录的 DNA分子区域protein_bind核酸上非共价的蛋白质结合位点RBS 核糖体结合位点repeat_region含有重复单位的基因组区域repeat_unit单个重复元件rep_origin复制起点;复制核酸以得到两个相同拷贝的起始位点RRNA 成熟的核糖体 RNA;将氨基酸装配成蛋白质的核糖核蛋白颗粒(核糖体)中的RNA成份S_region 免疫球蛋白重链的开关区;它参与重链 DNA的重排,导致来自相同 B细胞的不同免疫球蛋白类的表达Satel

13、lite 短的基本重复单位的很多串联重复(相同或相关的);大多数具有的碱基组成或其它性质与基因组的一般水平不同,这使得它们与大部分(主带)的基因组 DNA分离开来ScRNA 小的细胞质 RNA;几个小的细胞质分子中的任何一个存在于真核生物的细胞质和(有时)核中sig_peptide信号肽编码序列;被分泌的蛋白质的末端结构域的编码序列;此结构域涉及新生多肽与膜的结合;前导序列SnRNA 小的核 RNA;很多小的 RNA种类中的任何一个都被局限于核中;几个 snRNA参与剪接或其它 RNA加工反应source 鉴定序列中特定范围的生物来源;此关键词是强制性的;每一项至少要有一个跨越整个序列的单一来

14、源关键词;每个序列可允许有一个以上的来源关键词stem_loop 发卡结构;由 RNA或 DNA单链的相邻(反向)互补序列之间的碱基一配对形成的双螺旋区域STS 序列标记位点:表述基因组上作图界标并能通过 PCR检测的短的,单拷贝 DNA序列;通过测定 STS系列的次序即可作出图谱的基因组区域TATA_signalTATA盒;Goldberg-Hogness 盒;在每个真核生物 RNA聚合酶转录单位起点前约 25bp处发现的保守的富含 AT的七聚体,它可能涉及使酶定位以正确地起始;共有序列TATA(或)(或)terminator或者位于转录本的末端或者与启动子区域相邻的 DNA序列,该序列可导

15、致 RNA聚合酶终止转录;也可以是阻抑蛋白的结合位点transit_peptide转运肽编码序列;核编码的细胞器蛋白质末端结构域的编码序列;此结构域参与将蛋白质翻译后运送到细胞器中tRNA 成熟的转移 RNA,,小的 RNA分子(7585 个碱基长) ,介导核酸序列翻译成氨基酸序列unsure 作者不能确定此区域的准确序列V_region 免疫球蛋白轻链和重链的可变区,和细胞受体 , 和 链;编码可变的氨基末端部分;可由 Vsegment,D_segment,N_region 和 J_segment组成V_segment 免疫球蛋白轻链和重链的可变区段,和 T 细胞受体 , 和 链;编码大多数

16、可变区(v_region)和前导肽的最后几个氨基酸variation 含有来自相同基因的稳定突变的相关系列(例如 RFLP,多态性等) ,在此(和可能其它)位置处所述相同基因与被表述的不同3clip 在加工过程中被切下的前体转录本 3端大部分区域3UTP 不被翻译成蛋白质的成熟转录本的末端区域(终止密码子之后)5clip 在加工过程中被切下的前体转录本端大部分区域5UTP 不被翻译成蛋白质的成熟转录本的末端区域(起始密码子之前)_ 10 _signalPribnow盒;细菌转录单位起点上游约 10bp处的保守区域,它可能参与结合RNA聚合酶;共有序列=TatAaT_ 35 _signal细菌转

17、录单位起点上游约 35bp处的保守六聚体;共有序列=TTGACa或TGTTGACA与蛋白质序列相关的特征关键词表关键词 说明CONFLICT 不同的论文报道了不同的序列VARIANT 作者报道存在序列变体VARSLIC 由可选择的剪接产生的序列变体的表述MUTAGEN 经实验操作已改变的位点MOD_RES 残基的翻译后修饰ACETYLATION N末端或其它AMIDATION 通常位于成熟的活性肽的 C末端BLOCKED 不能被测定的 N或 C末端封闭基团FORMYLATION N末端甲硫氨酸的GAMMA-CARBOXY-GLUTAMIC ACIDHYDROXYLATION天冬酰胺,天冬氨酸,

18、脯氨酸或赖氨酸的METHYLATION 通常为赖氨酸或精氨酸的PHOSPHORYLATION 丝氨酸,苏氨酸,酪氨酸,天冬氨酸或组氨酸的PYRROLIDONECARBOXYLICACID 已形成内部环内酰胺的 N末端谷氨酸SULFATATION 通常为酪氨酸的LIPID 脂质组成成分的共价结合MYRISTATE 通过酰胺键与蛋白质成熟形式的 N末端甘氨酸残基或内部的赖氨酸残基结合的豆蔻酸基团PALMITATE 通过硫酯键与半胱氨酸残基或通过酯键与丝氨酸或苏氨酸残基结合的棕榈酸基团FARNESYL 通过硫酯键与半胱氨酸残基结合的法尼基GERANYL-GERANYL 通过硫酯键与半胱氨酸残基结合的

19、香叶基香叶基基团GPIANCHOR 与蛋白质成熟形式末端残基的 羧基相连的糖基磷脂酰肌醇(GPI)基团NACYLDIGLYCERIDE原核生物脂蛋白成熟形式的 N末端半胱氨酸,所述脂蛋白具有酰胺键联的脂肪酸和通过酯键连接了两个脂肪酸的甘油基DISULFID二硫键;“FROM”和“TO”终点表示通过一个链内二硫键连接的两个残基;如果“FROM”和“TO”终点是完全相同的,则二硫键是链间键,而说明书领域示出交联的性质THIOLEST 硫醇酯键;“FROM”和“TO”终点表示通过硫醇酯键连接的两个残基THIOETH 硫醚键;“FROM”和“TO”终点表示通过硫醚键连接的两个残基CARBOHYD 糖基

20、化位点;碳水化物(如果已知)的性质在说明书领域给出METAL 金属离子的结合位点;说明书领域示出金属的性质BINDING 任何化学基团(辅酶,辅基,等等)的结合位点;基团的化学性质在说明书领域给出SIGNAL 信号序列的范围(前肽)TRANSIT 运转肽的范围(线粒体,叶绿体或微体)PROPEP 前肽的范围CHAIN 成熟蛋白质中多肽链的范围PEPTIDE 被释放的活性肽的范围DOMAIN 序列中感兴趣的区域的范围;所述区域的特征在说明书领域给出CABIND 钙结合区域的范围DNABIND DNA-结合区域的范围NP_BIND 核苷酸磷酸酯结合区域;核苷酸磷酸酯的特征示于说明书领域TRANSM

21、EM 转膜区域的范围ZN_FING 锌指区域的范围SIMILAR 与另一个蛋白质序列具有相似性的区域;与那个序列有关的精确的资料在说明书领域给出REPEAT 内部序列重复的范围HELIX 二级结构;螺旋,例如 螺旋,(10)螺旋,或 Pi-螺旋STRAND 二级结构;链,例如氢键连接的 链,或分离的 桥中的残基TURN 二级结构转角,例如键连的转角(转角,转角或转角)ACT_SITE 涉及酶活性的氨基酸SITE 序列中任何其它感兴趣的位点INIT_MET 已知序列以起始密码子甲硫氨酸开始NON_TER序列末端的残基不是末端残基;如果应用于位置,这表示第一个位置不是完整分子的末端;如果应用于最后一个位置,这表示此位置不是完整分子的末端;对此关键词没有说明书领域NON_CONS 非连串残基;表示序列中的两个残基不是连串的,在它们之间有很多末测序的残基UNSURE 序列的不确定性;用于表述不能确定序列排列的序列区域

展开阅读全文
相关资源
相关搜索

当前位置:首页 > 实用文档资料库 > 策划方案

Copyright © 2018-2021 Wenke99.com All rights reserved

工信部备案号浙ICP备20026746号-2  

公安局备案号:浙公网安备33038302330469号

本站为C2C交文档易平台,即用户上传的文档直接卖给下载用户,本站只是网络服务中间平台,所有原创文档下载所得归上传人所有,若您发现上传作品侵犯了您的权利,请立刻联系网站客服并提供证据,平台将在3个工作日内予以改正。