1、,分子生物学国家重点实验室工 作 报 告（2001.012005.12）,金由辛,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所,一、研究工作与成果二、队伍建设与人才培养三、国内外地位与优势四、发展规划与设想,报 告 内 容,历史沿革,研究方向,一、研究工作与成果,紧密结合“人口与健康”这一国家重大需求,为防治人类重要疾病、培养生物新品种提供理论依据，建成一个在分子生物学领域从事基础性研究的实验室，跻身国际前列，并为我国国民经济建设作出贡献。,总体定位,认识未知的世界,突出原创性(基础性研究)建立研究系统和新的实验技术(国际前列)为解决国家重大需求作贡献(国家需求),一、研究工作与成果
2、,承担任务,承担国外研究项目,一、研究工作与成果,研究总经费,2001-2005年，共11618万,科 研 经 费： 7850万管 理 费： 750万依托单位投入： 2718万设 备 更 新 费： 300万,组均经费800余万,一、研究工作与成果,2001-2005年，共发表论文220篇，其中SCI论文206篇，联系作者/第一作者197篇。SCI论文总影响因子646。论文中有152篇被引用，总引用频次1041次，其中他引820次。合计发表IF4论文57篇（上届12篇）。,论文发表情况,一、研究工作与成果,论文发表情况比较,122.6,20,646,820,199,220,59,133,一、研究
3、工作与成果,获奖情况,王恩多（2001）刘望夷（2005）,一、研究工作与成果,上海市科技进步奖,戚正武（ 2003 ）,戚正武（ 2005 ）,刘望夷（ 2003 ）,国家自然科学二等奖,专 利,已申请发明专利39项已获批准授权发明专利20项（1项国际）,一、研究工作与成果,一、研究工作与成果,代表性研究成果,基因的表达、调控与功能,人类生殖系统发育与疾病研究,真核生物的生殖与发育是当今生物学研究热点之一，生殖细胞的分化发育与形态发生在人口与健康问题的研究中占有重要的地位。,主要完成人：张永莲、陈江野、金由辛等,代表性研究成果（一）,附睾自身免疫系统天然抗菌肽,起始精子运动,Science
4、March 1, 2001使21世纪追求的既能避孕，又能防止性传播感染的双功能药物的出现成为可能,Nature Cell Biology May 1, 2004迄今为止，被发现的第一个附睾蛋白质与精子作用后刺激其功能,代表性研究成果（一）,Editorial Comments:“A Condom in Pill Form?”New findings may offer a lead for developing a drug that offers both contraception and STD prevention. Chinese researchers have identifie
5、d a peptide, called Bin1b, that is expressed in the male rats reproductive tract, and seems to have equivalents in humans and chimpanzees. The peptide is related to a group of other anti-microbial molecules called -defensins, and is expressed only in the sex organ called the epididymus, which may be
6、 a reservoir for sexually transmitted bacteria and viruses, including HIV. In addition to showing antimicrobial activity, Bin1b is also responsible for sperm maturation, storage, and protection, suggesting that the peptide may be a useful target for drugs that would both stop sperm production and pr
7、otect against STDs.,编辑短评：药片型的避孕套中国研究者的这一新发现可能提供引导一种既可避孕又能防止性传播感染的双功能药物的出现. . . . . .,代表性研究成果（一）,发表在Science的文章在国际上引起巨大反响，已被他引72次。在国际上掀起了附睾-defensin自身防御机制和男性避孕的研究高潮。共发表SCI论文11篇，平均每篇的IF值8.0，他引频次达13次。 张永莲2001年当选中科院院士，获2002年度何梁何利生命科学奖和2004年度上海市科技功臣称号。 获得美国Fogarty基金会的连续资助。获973一项、基金委重点两项、863两项、中科院重要方向性项目一项
8、和上海市重大项目一项的支持。,成果一小结,代表性研究成果（一）,氨基酰-tRNA合成酶与相关tRNA的相互作用在维持正常生命活动中的功能,主要完成人：王恩多、金由辛等,代表性研究成果（二）,代表性研究成果（二）,为阐明蛋白质生物合成精确性的机理作出了贡献，为药物设计提供潜在的靶点。,Nucleic Acids Res, J Biol Chem, Biochem J各4篇，Biochem. 2篇,现代的LeuRS可能是由双链进化而来。20氨基酸结构模体犹如LeuRS的进化遗迹。(人的阑尾?)LeuRS独立的CP1结构域可与tRNA的进化早期的小螺旋相互作用，从另一个角度证明了aaRS/tRNA共
9、进化。,EMBO J四位审稿人的一致好评。认为该研究为合成酶与tRNA共进化理论提供了依据，将影响许多研究项目的提出。,代表性研究成果（二）,发表研究论文20篇，平均影响因子5.3；已被73篇研究论文引用。 王恩多研究员2005年当选中科院院士。获国家自然科学奖二等奖（王恩多等，2001）获全国优秀博士论文（李勇，2002）,成果二小结,代表性研究成果（二）,染色体和染色质结构的稳定与白血病发生的相关性,主要完成人：徐国良、周金秋等,Science 2002, 297:1824-1827,核小体,代表性研究成果（三）,Cell 121, 167-178, 2005,代表性研究成果（三）,Med
10、ical Science News中对该论文作出如下评论：“这项基于小鼠骨髓细胞的研究发现为开发AML急性白血病治疗新药提供了潜在靶点”。,第一次证明表观遗传学方面的改变引发了白血病。发表了Cell、J Biol Chem、Biochem J 等论文， 2005年发表的Cell论文，当年引用频次9次。中国科学院“百人计划”终期评估为“优秀”，获得100万元后续资助。获国外3项经费支持，其中德国马普学会2项，欧盟合作项目1项，合计45万欧元。获973两项、国家杰青两项、中科院百人计划2项和上海市项目等支持。,成果三小结,代表性研究成果（三）,脂类代谢的细胞和分子机制,研究针对肥胖与心血管疾病。发
11、表了Cell Death and Differ、J Biol Chem、Biochem J等论文。发表影响因子大于6的研究论文5篇。一篇发表在J Biol Chem上的论文他引达42次。廖侃进入国家基金委创新群体。获得973、863、基金委重大、中科院和上海市项目等支持。英国Future Cardiology约稿综述。,主要完成人：廖侃、李伯良等,代表性研究成果（四）,此工作为系统工作，获得2003年度上海市科技进步二等奖和2005年国家自然科学奖二等奖。获国家基金委面上项目1项，中科院重要方向性项目1项，研究所、实验室继续资助经费。,代表性研究成果（五）,核糖体失活蛋白及核糖体RNA结构与功
12、能,主要完成人：刘望夷等,核糖体失活蛋白（RIP）专一失活核糖体，导致细胞死亡。它可用作抗癌抗病毒感染药物或杀虫剂等，也可作为研究rRNA结构与功能的工具酶。,代表性研究成果总结,工作连续，系统性强成果影响力大，获奖多在顶尖杂志上发表论文创新文化成绩卓越,科学编辑短评药片型的避孕套,第一次证明表观遗传学方面的改变引发了白血病,他引173次,证明了tRNA与合成酶的共进化,一、研究工作与成果,一、研究工作与成果二、队伍建设与人才培养三、国内外地位与优势四、发展规划与设想,报 告 内 容,队伍建设,二、队伍建设与人才培养,现有科研人员43人,队伍建设,二、队伍建设与人才培养,本届期间4位当选院士,
13、原因：研究所、实验室的优良传统，浓厚的 学术氛围，长期系统的工作与积累,队伍建设,张永莲（2001）,张友尚（2001）,林其谁（2003）,王恩多（2005）,二、队伍建设与人才培养,中青年优秀人才,本届前后有8位杰青基金获得者，6位百人计划引进人才。,二、队伍建设与人才培养,人才培养,出站博士后9名获博士学位70名在读硕博士生100名,二、队伍建设与人才培养,学生获奖情况,全国优秀博士学位论文奖 2人次 李勇（ 2002，导师王恩多）， 李鹏（ 2003，导师张永莲）全国优秀博士学位论文提名奖 2人次 陈剑峰（ 2004，导师王恩多）， 惠利健（ 2005，导师胡赓熙）中国科学院优秀博士学
14、位论文奖 1人次 惠利健（ 2004，导师胡赓熙）中国科学院院长特别奖 3人次 李鹏（ 2001，导师张永莲），任秀荣（ 2001，导师敖世洲）， 赵明炜（ 2005，导师王恩多）,二、队伍建设与人才培养,各种冠名奖共63人次，很多老师也获得了优秀导师奖。很多毕业生在国内外成为PI等。,报 告 内 容,一、研究工作与成果二、队伍建设与人才培养三、国内外地位与优势四、发展规划与设想,1998年109次香山会议上 提出了RNA组学。男性避孕与副睾抗菌肽方面引领了国际研究的方向。tRNA与氨酰tRNA合成酶的识别、核糖体失活蛋白的结构与功能研究、表观遗传学方面的研究等在国际上有很高的影响度，主办了在
15、国际上有重要影响的学术会议。在国际热点、前沿领域（表观遗传学、非编码RNA等）973项目的组织中起决定性的作用，获得了很多国家级重大任务和国外资助。,国际学科前沿,PNAS, 2000, 97: 14035-37,三、国内外地位与优势地位,国际机构任职,胡赓熙Environmental Health Perspective， Reviewer,金由辛RNA Biology，编委,林其谁亚大生物化学家与分子生物学家联合会(FABMB)，主席国际细胞研究组织(ICRO)，副主席,张永莲Androlodia (德国)，编委,三、国内外地位与优势地位,国际合作与交流,三、国内外地位与优势地位,国际合作
16、项目,张永莲的Fogarty项目基金已获延续，又获2006年后的22.5万USD资助。,三、国内外地位与优势地位,4次全球性会议,三、国内外地位与优势地位,19th International tRNA workshop “tRNA 2002”,地区性会议1次全国性会议2次其它大型学术会议3次,三、国内外地位与优势地位,中科院马普青年科学家小组,徐国良（马普三组） 周金秋（马普四组）,胡赓熙（马普二组）,三、国内外地位与优势地位,国内合作与交流,三、国内外地位与优势地位,出国访问 112 人次，接待来访 87 人次。以通讯作者/第一作者身份发表论文：92/197,开放交流实效显著,三、国内外地
17、位与优势优势,Okada, et al. Cell, 121: 167 (2005)Mao, et al. Mol Cell, 7: 801 (2001)Zheng et al. Nucleic Acids Res. 32: 3294(2004).,Li, et al. Science, 291: 1783 (2001)Zhang, et al. Cancer Res, 64: 7579 (2004) Liu, et al. Nucleic Acids Res, 29: 783 (2001),Hao, et al. Nucleic Acids Res, 33: 3606 (2005)Huo,
18、et al. J Biol Chem, 278: 11561 (2003) Jia, et al. J Biol Chem, 279: 41960 (2004),与国内合作发表论文52篇,与所内其它实验室合作发表论文13篇,与国外合作发表论文27篇,以院士为核心的人才队伍,三、国内外地位与优势优势,竞争力强,承担国外研究项目,三、国内外地位与优势优势,研究领域瞄准国际前沿与热点,三、国内外地位与优势优势,所有课题组的工作均已延伸到细胞生物学方面,很多课题组的工作向结构生物学和生物信息学延伸,向其它领域延伸,三、国内外地位与优势优势,成果累累,国家自然科学二等奖2项,全国优秀博士论文奖2项,三、
19、国内外地位与优势优势,技术保障坚实,表观遗传学平台,经典遗传学平台,分子生物学国家重点实验室,RNA组学平台,生化与细胞所,细胞研究分析中心,干细胞技术平台,抗体研究中心,动物实验中心,上海生科院,蛋白质组平台,芯片平台,Knock out 平台,三、国内外地位与优势优势,生物信息学平台,科研环境优良,预计2006年9月竣工总建筑面积 2.3万平方米,生化细胞所,上海生科院,三、国内外地位与优势优势,Isolated the old cells from culture,组长会议,联合申请重大课题,实验室内部密切交流与合作,三、国内外地位与优势优势,创新文化建设扎实,继承老科学家的优良传统：耐
20、得寂寞不赶潮流的平静心态与勇于参加国际竞争的进取精神，严谨踏实的学风，几十年如一日刻苦努力的工作作风。竞争合作机制：有竞争又有协作帮助和人性化管理。营造浓厚学术氛围。实事求是的科学发展观：考核价值趋向不急功近利，允许鼓励课题组长们在单位的学科发展方向中，有自己的个性、自己的领域（即同中有异），形成基础研究学科发展的多样性等。,三、国内外地位与优势优势,创新体制管理规范,开放基地 接待来访，科普网站、年报 信息公开透明管理 严格细致,开放课题 注重实效 刘望夷 国家自然科学二等奖（2005） 上海市科技进步二等奖（2004）,三、国内外地位与优势优势,一、研究工作与成果二、队伍建设与人才培养三、国内外地位与优势四、发展规划与设想,报 告 内 容,表观遗传学基因组学RNA组学,四、发展规划与设想,科技部、国家自然科学基金会、中科院、上海市科委 历届学术委员会成员固定成员、研究生、客座成员和国内外学术界同行,感谢,
