塘养三疣梭子蟹弧菌的群落结构分析【开题报告】.doc

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1、毕业论文开题报告食品质量与安全塘养三疣梭子蟹弧菌的群落结构分析一、选题的背景与意义1三疣梭子蟹(PORTUNUSTRITUBERCULATUS)养殖规模的日益扩大、集约化程度的逐步提高和养殖环境的污染等导致了三疣梭子蟹免疫防御系统抗病力下降,对病害的易感性增加,越来越多的养殖环境遭到了严重破环。2弧菌病(VIBRIOSIS)作为弧菌所引起一种细菌性疾病,是最早发现的鱼类细菌性疾病之一,现已成为海水养殖动物主要细菌性病害之一,对养殖业的危害严重,常常造成极大的经济损失。因此,该类疾病的弧菌也一直备受国内外研究工作者的关注,是海水养殖动物病害的主要研究领域之一。3分子生物学技术和基因组学的不断成熟

2、和广泛应用,为微生物生态学的发展提供了新的研究方法。二、研究的基本内容与拟解决的主要问题1从弧菌的菌落计数出发,通过菌落特征的观察和16SRDNA基因序列比对,对三疣梭子蟹养殖塘健康蟹和病害蟹中弧菌群落结构变化进行比较研究,并进行了系统发育学分析,以期揭示其种群组成与弧菌病的关系。2找出三疣梭子蟹的发病与养殖塘水体中弧菌数量的关系,以及与蟹体内的弧菌菌落结构的相关性。3了解塘养三疣梭子蟹中弧菌的多样性,对发展健康养殖业具有重要的意义。三、研究的方法与技术路线1基于传统的微生物培养方法与现代分子生物学(PCRDGGE)、生物信息学的结合,对养殖塘三疣梭子蟹弧菌群落结构进行研究。2技术路线四、总体

3、的安排与进度12009年7月10月三疣梭子蟹样品采集,查询与论文有关的资料、撰写试验计划熟悉基本的实验操作;22009年7月2010年6月蟹体中弧菌的分离培养,弧菌菌落计数,根据菌落、菌体形态将弧菌进行初步归类,弧菌的保存,弧菌基因组DNA的提取;32010年9月PCRDGGE筛选出不同发育型,测序并进行系统发育学分析和对养殖塘三疣梭子蟹中弧菌群落结构进行初步分析,获得初步结果;42010年10月实验数据的整理分析以及对整个试验的补充、完善阶段;5预期于2010年12月底完成毕业论文的撰写。五、主要参考文献1RASMUSSENLD,EKELUNDF,HANSENLH,ETALGROUPSPEC

4、IFICPCRPRIMERSTOAMPLIFY24SASUBUNITRRNAGENESFROMKINETOPLASTIDAPROTOZOAUSEDINDENATURINGGRADIENTGELELECTROPHORESISJMICROBECO2001,421091152常建波,常向红,孙逢贤,等养殖牙鲆弧菌病病原菌初步研究J海洋水产研究,2001,22137413张朝霞,王军,张蕉南,等东山九孔鲍细菌性疾病研究J台湾海峡2001,2021932004沈亚林,于业绍副溶血弧菌对文蛤致病性及其防治J水产学报1993,173249452三疣梭子蟹样品采集弧菌的分离培养弧菌菌落计数依据菌落、菌体形态进

5、行初步归类弧菌基因组DNA的提取PCRDGGE筛选出不同发育型测序对养殖塘三疣梭子蟹中弧菌群落结构进行分析论文撰写5HOLTJGBERGEYSMANUALOFDETEMINATIVEBACTERIOLOGYJ9THED,WILLIAMSWILKINS,19941901946李亚晨,包永明,吕建发,等海洋水产动物弧菌病的生物防治J水产科学,2004,23235387BERGMANAMDIEROTEBEULENKRANKHEITDESAALJBERBOILVERSUCHSSTA,1909210548倪纯治,林燕顺等海水养虾池的几种致病弧菌生态J台湾海峡1995,14173799AGUIRREGUZ

6、MAN,HUMBERTOMEJIARUIZ,FELIPEASCENCIOAREVIEWOFEXTRACELLULARVIRULENCEPRODUCTOFVIBRIOSPECIESIMPORTANTINDISEASESOFCULTIVATEDSHRIMPJAQUACULTURERESEARCH2004,351395140410王国良,金珊,陈寅儿,李政三疣梭子蟹肌肉乳化病的病原及其致病性研究J海洋科学进展2006,24452653111陈萍,李吉涛,李健,刘淇,刘萍溶藻弧菌对三疣梭子蟹抗氧化酶系统的影响J海洋科学2009,335596312REESONAF,JANKOVICT,KASPERML,

7、ETALAPPLICATIONOF16SRDNADGGETOEXAMINETHEMICROBIALECOLOGYASSOCIATEDWITHASOCIALWASPVESPULAGERMANICAJINSECTMOLECULARBIOLOGY,2003,12859113JIANG,SCVIBRIOCHOLERAEINRECREATIONALBEACHWATERSANDTRIBUTARIESOFSOUTHERNCALIFORNIAJHYDROBIOLOGIA460,PP157164,200114丁雪燕,周志明海水虾淡化养殖技术M杭州浙江科学技术出版社200015张德民,黄志勇等紫色非硫细菌RHOD

8、OCISTA属一新分离株的鉴定及其系统学研究J微生物学报2000,41142016MORIARTY,DJWTHEROLEOFMICROORGANISMSINAQUACULTUREPONDSJAQUACULTURE15114,PP333349199717谢文阳,邱秀慧,海洋弧菌多样性J,世界科技研究与发展2005,27244118RIKARDDRYSELIUS,KENKUROKAWA,TETSUYAIIDAVIBRIONACEAEAVERSATILEBACTERIALFAMILYWITHEVOLUTIONARILYCONSERVEDVARIABILITYJRESEARCHINMICROBIOLOGY2007,15847948619许文军,金海卫,丁跃平秋冬季三疣梭子蟹暂养常见疾病及防治措施J现代渔业信息2004,197232520刘淇,李海燕,王群等梭子蟹牙膏病病原菌溶藻弧菌的鉴定及其系统发育分析J海洋水产研究2007,28491321王国良,金珊,李政等三疣梭子蟹PORTUNUSTRITUBERCULATUS乳化病的组织病理和超微病理研究J海洋与湖沼2006,374297304

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