1、MS软件介绍,Introduce,Computer simulation techniques have become almost essential in the study of the macro-molecular phenomena and phase behavior on the molecular level. As these techniques become increasingly important, it is necessaryto realize that they are useful tools, but are not the goals of rese
2、arch.,Introduce,Molecular Simulation exists to bring together the most significant papers concerned with applications of simulation methods using statistical mechanics, and original contributions to the development of simulation methodology. The aim is to provide a forum in which cross fertilization
3、 between application areas and methodologies can take place and new developments can be encouraged.,分子模拟的相关介绍,现在三种主要研究方法:理论实验模拟,分子模拟的相关介绍( 多尺度模拟),分子模拟的相关介绍,MS (molecular simulation)分子模拟缩写。分子模拟是理论和实验的桥梁。实验是通过理论的模型化和假设实现的；模拟是通过实验的模型化实现的；理论是对模拟的假设和预测。分子模拟的优点： （1） 省钱； （2） 安全； （3） 极限条件，如超高温、低温，超高压、低压，以及时
4、间倒流等。,分子模拟的相关介绍,分子模拟的方法及特点比较： MC(Monte Carlo) MD(Molecular Dynamics)统计力学 分子动力学系综平均 时间平均静态的 动态的状态 过程,分子模拟的相关软件,Materials Studio是Accelrys专为材料科学领域开发的新一代材料计算软件。采用Client/Server结构。 它能方便的建立3D分子模型，深入分析有机、无机晶体、无定形材料以及聚合物，可以在催化剂、聚合物、固体化学、结晶学、晶粉衍射以及材料特性等材料科学研究领域进行性质预测、聚合物建模和X射线衍射模拟，操作灵活方便，并且最大限度地运用网络资源。（Accelr
5、ys 一家著名公司，全球范围内能够提供分子模拟、化学信息学和生物信息学全面软件解决方案及相关服务的最大供应商。）,分子模拟的相关软件,模拟的方法包括量子力学的密度泛函理论、半经验的量化计算方法、分子力学、分子动力学以及介观模拟方法等。,分子模拟的相关软件,多种先进算法的综合运用使Material Studio成为一个强有力的模拟工具。无论是性质预测、聚合物建模还是X射线衍射模拟，我们都可以通过一些简单易学的操作来得到切实可靠的数据。灵活方便的Client-Server结构还是的计算机可以在网络中任何一台装有NT、Linux或Unix操作系统的计算机上进行，从而最大限度的运用了网络资源。,模块简
6、介,基本环境MS.Materials Visualizer分子力学与分子动力学MS.DISCOVERMS.COMPASSMS.Amorphous CellMS.ForciteMS.Forcite Plus,模块简介,晶体、结晶与X射线衍射 MS.Polymorph PredictorMS.MorphologyMS.ReflexMS.Reflex PlusMS.X-Cell,模块简介,量子力学 MS.Dmol3MS.CASTEPMS.NMR CASTEPMS.VAMP,模块简介,定量结构-性质关系 MS.SynthiaMS.QSAR相平衡 MS.Equilibria相平衡 MS.Equilibr
7、ia材料信息学MS.Fast FDSMS.CombiMat,主要模块介绍,MS Visualizer 提供了搭建分子、晶体及高分子材料结构模型所需要的所有工具，可以操作、观察及分析结构模型，处理图表、表格或文本等形式的数据，并提供软件的基本环境和分析工具以支持Materials Studio的其他产品。是Materials Studio 产品系列的核心模块。,MS.Amorphous Cell模块介绍,允许对复杂的无定型系统建立有代表性的模型，并对主要性质进行预测。通过观察系统结构和性质之间的关系，可以对分子的一些重要性质有更深入的了解，从而设计出更好的新化合物和新配方。可以研究的性质有:内聚
8、能密度(CED)、状态方程行为、链堆砌以及局部链运动等。,MS.CASTEP,先进的量子力学程序，广泛应用于陶瓷、半导体、金属等多种材料，可研究：晶体材料的性质（半导体、陶瓷、金属、分子筛等）、表面和表面重构的性质、表面化学、电子结构（能带及态密度）、晶体的光学性质、点缺陷性质（如空位、间隙或取代掺杂）、扩展缺陷（晶粒间界、位错）、体系的三维电荷密度及波函数等。,MS.CombiMat,应用于材料科学高通量实验（high-throughput experimentation）的先进的数据管理系统。无论是小规模的研究组，或是跨国公司在各地的研究机构，都可以使用CombiMat来进行数据管理。Co
9、mbiMat包括Oracle数据库及相关的应用模块,MS.COMPASS,支持对凝聚态材料进行原子水平模拟的功能强大的力场。是第一个由凝聚态性质以及孤立分子的各种从头算和经验数据等参数化并验证的从头算力场。可以在很大的温度、压力范围内精确地预测孤立体系或凝聚态体系中各种分子的结构、构象、震动以及热物理性质,MS.DMol3,独特的密度泛函（DFT）量子力学程序，是唯一的可以模拟气相、溶液、表面及固体等过程及性质的商业化量子力学程序，应用于化学、材料、化工、固体物理等许多领域。可用于研究均相催化、多相催化、分子反应性、分子结构等，也可预测溶解度、蒸气压、配分函数、溶解热、混合热等性质。,MS.D
10、PD,DPD (Dissipative Particle Dynamics)是先进的介观模拟方法，用于研究复杂的流体现象，包括颜料、药物、化妆品以及药物控释等。DPD可以提供流体在平衡态、剪切受力以及受限在狭窄空腔等条件下的结构和动力学性质，而且研究的时间和空间尺度超越了传统的基于原子水平的分子动力学方法。,MS.Equilibria,可计算烃类化合物单组分体系或多组分混合物的相图，溶解度作为温度、压力和浓度的函数也可同时得到，还可计算单元组分体系的virial系数。适用领域包括石油及天然气加工过程（如凝析气在高压下的性质）、石油炼制（重烃相在高压下的性质）、气体处理、聚烯烃反应器（产物控制）
11、、橡胶（作为温度和浓度的函数的不同溶剂的溶解度）等。,MS.Fast FDS,Accelrys最新发展的基于Oracle数据库的配方设计软件，可以帮助研究人员对配方设计所需的信息和知识进行存储、整理及分析，并在此基础上设计最优配方。其应用涵盖了配方设计的全过程，包括初始概念形成、试验设计以及配方优化等,MS.Forcite,先进的经典分子力学工具，可以对分子或周期性体系进行快速的能量计算及可靠的几何优化。包含Universal、Dreiding 等被广泛使用的力场及多种电荷分配算法。,MS.Forcite Plus,先进的经典力学模拟工具，能够进行能量计算、几何优化、动力学模拟。可对从简单分子到二维表面到三维周期等范围很广的结构进行上述操作。一整套的分析工具可用来对诸如偶极相关等复杂性质进行分析,MS.MesoDyn,相对于分子水平的模拟，MesoDyn是一种可以在更大的时间和空间尺度上研究复杂流体体系的动力学模拟方法，可以研究的体系包括高分子熔体及高分子共混体系。,Thanks for your attention,
