1、河 北 科 技 大 学 教 案 用 纸第 1 页 共 12 页第 5 次课 2 学时上次课复习:1.必需多不饱和脂肪酸?双亲分子?2.卵磷脂和脑磷脂的分子组成?3.血浆脂蛋白分为哪几类? 4.生物膜的主要组成引入新课本次课题(或教材章节题目):第三章 蛋白质(教材中 3,4,5,6,7 章)第一节 氨基酸(1)教学要求:1.掌握组成蛋白质的 20 种氨基酸的结构通式、三字符;各氨基酸结构特点;氨基酸分类2.掌握氨基酸的酸碱化学:等电点、两性解离;3.了解氨基酸的甲醛滴定;重 点:氨基酸的结构通式;氨基酸的分类;三字符;氨基酸酸碱化学、pK 值、pI;难 点:20 种氨基酸的结构特点;氨基酸的酸
2、碱化学教学手段及教具:课堂讲授与 PowerPoint 演示相结合。讲授内容及时间分配: 导入新课:5 分第一章 蛋白质 第二章 第一节 氨基酸(1)一、氨基酸-蛋白质的构件分子(15 分)二、氨基酸的分类(30 分)三、氨基酸的酸碱化学(35 分)小结:5 分课后作业1.蛋白质的 20 种氨基酸的结构特征?是否都有旋光性?是否都是 L- -氨基酸?2.必需氨基酸、酸性氨基酸和碱性氨基酸各是哪些氨基酸?3. 兼性离子?pK 值?pI?电泳?氨基酸处在大于自身 pI 的 pH 溶液中净电荷为正还是负?4.哪种氨基酸在生理 pH 范围内具有缓冲能力?为什么?5. 把一个氨基酸结晶加入到 pH7.0
3、 的纯水中,得到了 pH6.0 的溶液,问此氨基酸的 pI 值是大于 6.0?小于 6.0?等于 6.0?6.写出组氨酸在 pH 1、4、 8、12 时组氨酸的净电茶是怎样的?对每个 pH 来说,当电泳时,组氨酸是向阳极还是向阴极迁移?书后 155 页习题:2,3, 5,6参考资料生物化学与分子生物学科学出版社 王联结 第二版普通生物化学高等教育出版社 郑集 第三版生物化学解题指导与测验高等教育出版社 张楚富 河 北 科 技 大 学 教 案 用 纸第 2 页 共 12 页第 6 次课 2 学时第三章 蛋白质(protein)(123页 第3,4,5,6,7章)上次课复习: 1. 蛋白质的 20
4、 种氨基酸是否都是 L- -氨基酸?2. 酸性氨基酸和碱性氨基酸各是哪些氨基酸?3. 哪种氨基酸在生理 pH 范围内具有缓冲能力?4. 氨基酸处在大于自身 pI 的 pH 溶液中净电荷为正还是负?本次课题(或教材章节题目):第三章 蛋白质 第一节 氨基酸(2)教学要求:1.掌握 Sanger 试剂和 Edman 反应;侧链巯基的化学反应; 了解其它的化学反应;2.掌握氨基酸的光学活性和光谱性质;3.掌握氨基酸混合物的分离原理及方法:纸层析、柱层析、离子交换层析重 点: Sanger 试剂和 Edman 反应;侧链巯基的化学反应;氨基酸紫外吸收;纸层析和离子交换层析分离分离氨基酸的原理; 难 点
5、: 纸层析和离子交换层析分离分离氨基酸的原理教学手段及教具:课堂讲授与 PowerPoint 演示相结合。讲授内容及时间分配:复习:5 分第一节 氨基酸四、氨基酸的化学反应(30 分)五、氨基酸的光学活性和光谱性质(20 分)六、氨基酸混合物的分析分离(30 分)小结:5 分课后作业1.-氨基酸的烃基化反应常用的二种试剂是?氨基酸自动分析仪依据哪种反应原理设计?2.-氨基酸的茚三酮反应呈现的颜色是否都一样?3.米伦反应、坂口反应和 Pauly 反应是哪些氨基酸侧链的反应?4.半胱氨酸的巯基都有哪些反应?常用的打开二硫键的氧化剂和还原剂是什么?5.哪三种氨基酸在 280nm 紫外光下有吸收峰?原
6、因是?紫外吸收法测定蛋白质浓度的理论依据是?6.氨基酸纸层析、离子交换层析的原理?155 页:11,14,15参考资料蛋白质分子基础高教出版社 第二版 陶慰孙等生物化学与分子生物学科学出版社 王联结 第二版普通生物化学高等教育出版社 郑集 第三版生物化学解题指导与测验高等教育出版社 张楚富 河 北 科 技 大 学 教 案 用 纸第 3 页 共 12 页第一节 蛋白质概述第二节 氨基酸第三节 蛋白质的共价结构第四节 蛋白质的三维结构第五节 蛋白质结构与功能的关系第六节 蛋白质的性质、分离与纯化第一节 蛋白质概述 157页 蛋白质的化学组成与分类 蛋白质的构象和结构 蛋白质生物学功能蛋白质的概念
7、存在于所有的生物细胞中,是由20种氨基酸按一定的序列通过酰胺键(蛋白质化学中称为肽键)缩合而成的,具有较稳定的构象,是构成生物体最基本的结构物质和功能物质。相对分子质量由数千到数千万。 有些蛋白质尚含有非蛋白成分。 一、蛋白质化学组成与分类 化学组成特点 蛋白质的分类1.元素组成特点 蛋白质的含氮量接近于16%蛋白质系数:1克氮所代表的蛋白质质量(克数,6.25)蛋白质系数是凯氏定氮法测定蛋白质含量的基础粗蛋白含量 样品含氮量 6.25 蛋白质含量 = 样品蛋白氮 6.25 有些还含有e/Cu/Zn/Mn等.三聚氰胺 是一种重要的氮杂环有机化工原料,主要用于生产三聚氰胺-甲醛树脂,广泛用于木材
8、加工、塑料、涂料、造纸、纺织、皮革、电气、医药等行业,目前是重要的尿素后加工产品。此外三聚氰胺还可以作阻燃剂、减水剂、甲醛清洁剂等。 动物长期摄入三聚氰胺会造成生殖、泌尿系统的损害,膀胱、肾部结石,并可进一步诱发膀胱癌。2.蛋白质的分类 分类依据生物来源、理化性质、分子形状、化学组成、化学结构与功能等。 常用的分类方法根据组成按分子形状(1)根据组成不同 (158 页,表41, 42)河 北 科 技 大 学 教 案 用 纸第 4 页 共 12 页 单纯蛋白质:根据溶解度进行分 结合蛋白质(亦称缀合蛋白质,辅基与多肽共价或非共价结合)(2)蛋白质的形状和大小 纤维状蛋白质:轴比大于10,多不溶于
9、水和稀盐溶液。 球状蛋白质:轴比小于10,易溶于水蛋白质的相对分子质量 159页,表44 残基数目/链:单一链、两种链、三种链等。单体蛋白质(monomeric protein)寡聚(多聚)蛋白质(亚基之间非共价键结合) 简单蛋白质的相对分子质量110氨基酸残基数(3)根据营养价值分类 缺价蛋白质(不完全蛋白质) 蛋白质中缺乏某个或某些必需氨基酸。 完全蛋白质 含有8种必需氨基酸的蛋白质。蛋白质互补作用:二、蛋白质的生物学功能 160页1.是生物体内重要的组成成分和结构成分2.功能的多样性和复杂性 催化功能:酶 调节功能:激素、受体、毒蛋白等。 结构功能:细胞和组织的主要组成成分。 运输功能:
10、血红蛋白、铁蛋白、载脂蛋白。 免疫功能:抗体 运动功能:肌动蛋白、肌球蛋白、纤毛、鞭毛。 储藏功能:乳液中的酪蛋白、蛋类中的卵清蛋白、植物种子中的醇溶蛋白等。 生物膜的功能:通透性、信号传递、遗传控制、生理识别、动物记忆、思维等。三、蛋白质构象和蛋白质结构层次 图41 构象(conformation)分子在空间采取的特定形态。(以X射线衍射法研究为主) 蛋白质结构的不同组织层次结构组织层次:一、二、三、四级结构。介于二和三级结构之间:超二级结构和结构域第一节 氨基酸(amino acid) 123页一、氨基酸蛋白质的构件分子二、氨基酸的分类三、氨基酸的酸碱化学四、氨基酸的化学反应五、氨基酸的光
11、学活性和光谱性质六、氨基酸混合物的分析分离河 北 科 技 大 学 教 案 用 纸第 5 页 共 12 页一、氨基酸蛋白质的构件分子 蛋白质水解 氨基酸的一般结构1.蛋白质的水解 20种基本氨基酸 不常见的氨基酸2.氨基酸的一般结构 结构通式 结构特点 其它特性(1)结构通式 构型 氨基酸的构型指碳的构型(D与L型)。 组成蛋白质的氨基酸是L-型(2) 结构特点 除脯氨酸为-亚氨基酸外,均为-氨基酸。 除甘氨酸外, -碳原子都为不对称碳原子.其它特性每种氨基酸都有特殊的白色结晶形状,可用来鉴别氨基酸。溶点很高。氨基酸在中性pH时兼性离子。氨基酸除甘氨酸外都具有旋光性。二、氨基酸的分类 常见的蛋白
12、质氨基酸 (20种) 不常见的蛋白质氨基酸(少数几种) 非蛋白质氨基酸(150多种)1.常见的蛋白质氨基酸 (20种,124页) 按R基团的化学结构 根据侧链R基团的极性 根据人体能否自身合成按R基团的化学结构脂肪族氨基酸:15种 中性、酸性、碱性、含羟、含硫、含酰胺芳香族氨基酸:3种,苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸杂环氨基酸:2种,组氨酸、脯氨酸根据侧链R基团的极性 ( 127页 表32)非极性 R 基氨基酸:8种 不带电荷的极性 R 基氨基酸: 7种带正电荷的 R 基氨基酸:3种 带负电荷的 R 基氨基酸:2种根据人体能否自身合成必需氨基酸:8种,赖氨酸(Lys)、缬氨酸(Val)、蛋氨酸(Me
13、t)、色氨酸(Try)、亮氨酸(Leu)、异亮氨酸(Ile)、苏氨酸(Thr)、苯丙氨酸(Phe)半必需氨基酸:2种,Arg、His婴儿期供给不足非必需氨基酸:其余河 北 科 技 大 学 教 案 用 纸第 6 页 共 12 页R为C、H基团的氨基酸6种甘氨酸:丙氨酸: (- 氨基丙酸)缬氨酸:(-氨基异戊酸)亮氨酸:(-氨基异己酸)异亮氨酸:(-氨基-甲基戊酸)脯氨酸:(-吡咯烷基-羧酸)是一个亚氨基酸。注:含有支链的3个氨基酸均是必需氨基酸。R为芳香族基团的氨基酸3种苯丙氨酸:(-氨基-苯丙酸)酪氨酸:(-氨基-对羟基苯丙酸)色氨酸:(-吲哚-氨基丙酸)注:三个分子中含有苯环共轭体系的氨基酸
14、,在280nm处有吸收峰,Trp吸收最强,Tyr次之,Phe最弱。R为含硫基团的氨基酸2种半胱氨酸:(-氨基-巯基丙酸)侧链上含有一 巯基(-SH),SH 也是一个高反应性的基团。蛋氨酸:(-氨基-甲硫基丁酸)是个疏水氨基酸。R为含醇基基团的氨基酸2种丝氨酸:(-氨基-羟基丁酸)苏氨酸:(-氨基-羟基丁酸)R为碱性基团的氨基酸3种组氨酸:(-氨基-咪唑基丙酸)赖氨酸:(, -二氨基己酸)一个双氨基酸,含有-和-氨基。精氨酸:(-氨基-胍基戊酸)是20种氨基酸中碱性最强的氨基酸。R为酸性基团的氨基酸2种天冬氨酸:(-氨基丁二酸)谷氨酸:(-氨基戊二酸)R为含酰胺基团的氨基酸2种天冬酰胺:( -氨
15、基-羧基丙酰胺)谷氨酰胺:( -氨基-羧基丁酰胺)2.不常见的蛋白质氨基酸 128页 是在蛋白质合成后由常见的氨基酸经修饰而来的. 3.非蛋白质氨基酸 129页 大多是L-氨基酸衍生物 细菌中含有多种D-型氨基酸 有一些是重要的代谢物前体或代谢中间物(丙氨酸,鸟氨酸,瓜氨酸等).三、氨基酸的酸碱化学 129页 氨基酸的兼性离子形式 氨基酸的解离河 北 科 技 大 学 教 案 用 纸第 7 页 共 12 页 氨基酸的等电点 氨基酸的甲醛滴定1.氨基酸的兼性离子形式 两个事实溶点高;能使水的介电常数增高;2.氨基酸的解离 依照Bronsted-Lowry的酸碱质子理论(丹麦化学家布朗斯特和英国化学
16、家劳里于1923年提出 HA B A - + B H 氨基酸是一类两性电解质,完全质子化时多元酸甘氨酸的解离 分步解离;解离情况受环境中pH值的影响。解离常数 133页 表33 解离常数p Ka:表示解离基团有一半解离时的pH 。A A 0 H A H 解离常数按酸性递减顺序编号为:p Ka1, pKa2、 pKa3等。 氨基酸的解离常数用测定滴定曲线方法求(自学)氨基酸的解离常数用测定滴定曲线方法求 甘氨酸的滴定曲线谷氨酸的滴定(解离)曲线 组氨酸的滴定(解离)曲线 赖氨酸的滴定(解离)曲线 Handerson-Hasselbalch公式 可计算出在任一pH条件下一种氨基酸的各种离子的比例
17、氨基酸的带电状况与溶液的pH值有关。例:计算在pH5.0时,甘氨酸的阳离子、两性离子及阴离子所占的比例? ?生理条件下有明显的冲缓作用的氨基酸 缓冲剂:能阻止由于酸或碱的加入而引起的H 的变化。 组氨酸侧链咪唑基的pK为6.03. 氨基酸的等电点(isoelectric point,pI,133页) 等电点: 当溶液pH低于该氨基酸等电点时,氨基酸净电荷为正,反之为负。 氨基酸在等电点时溶解度最低不同氨基酸等电点不同 应用根据氨基酸的电荷不同(电泳法,离子交换层析)分离混合物。根据氨基酸的等电点不同(调节溶液pH )分离混合物。 电泳 在外电场的作用下,带电颗粒,如不处于等电点状态的分子,将向
18、着与电性相反的电极移动,这种现象称为。等电点的计算 133页 表33 (1)侧链不解离的中性氨基酸 p I = ( pK1 + pK2 )/2 河 北 科 技 大 学 教 案 用 纸第 8 页 共 12 页(2)侧链含有可解离基团的氨基酸 酸性氨基酸 p I = ( pK1 + pKR2 )/2 硷性氨基酸 p I = ( pK2 + pKR3 )/2 半胱氨酸 p I = ( pK1 + pKR2 )/2 酪氨酸 p I = ( pK1 + pKR2 )/24. 氨基酸的甲醛滴定 氨基酸不能直接用酸、碱滴定来进行定量测定 -氨基中的氮原子是亲核中心,可发生亲核加成和取代反应。 与甲醛发生羟甲
19、基化反应思考题 蛋白质系数;单纯蛋白质;结合蛋白质;单体蛋白质;寡聚蛋白质; 蛋白质的20种氨基酸的结构?是否都有旋光性?是否都是L- -氨基酸? 必需氨基酸有哪些? 兼性离子?pK值?pI?电泳?氨基酸处在大于自身pI的pH溶液中净电荷为正还是负?与电泳方向的关系 哪种氨基酸在生理pH范围内具有缓冲能力?为什么? 把一个氨基酸结晶加入到pH7.0的纯水中,得到了pH6.0的溶液,问此氨基酸的pI值是大于6.0?小于6.0?等于6.0? 写出某氨基酸在pH 1、4、8、12时组氨酸的净电荷是怎样的?对每个pH来说,当电泳时,某氨基酸是向阳极还是向阴极迁移? 书后155页习题:2,3, 5,6四
20、、氨基酸的化学反应 135页 -氨基参加的反应 -羧基参加的反应 -氨基和-羧基共同参加的反应 侧链R基参加的反应1.- 氨基参加的反应 与亚硝酸反应 与酰化试剂反应 烃基化反应 生成西佛碱的反应(Schiff) 脱氨基反应与转氨基反应(见下册)(1)与亚硝酸反应 是范斯莱克氨基氮测定法(van Slyke amino nitrogen method)的原理(2)与酰化试剂反应(3)烃基化反应 首先被Sanger用来鉴定多肽或蛋白质的N末端氨基酸。 2,4二硝基氟苯缩写为DNFB或FDNB,亦称Sanger试剂Frederick Sanger (桑格)河 北 科 技 大 学 教 案 用 纸第
21、9 页 共 12 页英国化学家,在生物化学领域的贡献很大,他两次获诺贝尔奖1958和1980年;1953年确定了牛胰岛素一级结构;1975年和1977年确定了DNA的两种用酶测序的方法加减法和终止法。 首先被Edman用于鉴定多肽或蛋白质的N端氨基酸。 苯异硫氰酸酯缩写为PITC(4)生成西佛碱的反应 西佛碱是以氨基酸为底物的某些酶促反应的中间物。2.-羧基参加的反应 第138页 成盐和成酯 成酰氯反应 脱羧基反应 叠氮反应3.-氨基和-羧基共同参加的反应 与茚三酮反应 成肽反应(1)与茚三酮反应 茚三酮在弱酸性溶液中与氨基酸共热,所有具有游离氨基的氨基酸都生成紫色化合物( 570)。 脯氨酸
22、和羟脯氨酸与茚三酮反应直接生成的是黄色化合物( 440)。(2)成肽反应3.侧链R基参加的反应 140页 蛋白质的化学修饰:就是在较温和的条件下,以可控制的方式使蛋白质与某些试剂起特异反应,以引起蛋白质中个别氨基酸侧链或功能团发生共价化学改变。酪氨酸的酚基精氨酸的胍基Cys侧链上的巯基(SH)(1)酪氨酸的酚基 140页 米伦反应(Millon) 与HgNO 3、Hg(NO 3)2、 HNO3作用呈红色;与浓硝酸作用生成黄色。 Pauly反应与重氮化合物反应生成橘黄色化合物。注: His的咪唑基与重氮化合物反应生成棕红色 在酪氨酸3,5位上碘化、硝化、重氮化反应。(2)精氨酸的胍基 坂口反应(
23、Sagakuchi)与次氯酸钠(或次溴酸钠)及-萘酚在氢氧化钠溶液中产生红色产物。 (3)Cys侧链上的巯基(SH) CH 2S 此阴离子是巯基的反应形式。与卤化烷生成稳定的烷基衍生物 可保护 -SH 以防被氧化。Cys巯基打开氮丙啶的环巯基能和各种金属离子形成络合物 -SH 酶遇到重金属离子而生成硫醇盐时,将导致酶失活。与二硫硝基苯甲酸(DTNB)反应 pH8.0时,在412nm波长处有强烈吸收。可用比色法定量测定半胱氨酸的含量。河 北 科 技 大 学 教 案 用 纸第 10 页 共 12 页巯基易受空气或其他氧化剂氧化两种氧化衍生物 形成二硫化物:胱氨酸的形成。 形成磺酸基:对游离的巯基具
24、有保护作用,保护Cly巯基之间的氧化。二硫键的还原(打开) SH 与 SS 是一对氧化还原体系。 常用的打开二硫键的试剂主要有 氧化剂:过甲酸(HCOOOH) 还原剂:巯基乙醇、巯基乙酸、二硫苏糖醇等。 (HSCH 2CH2OH) 游离的巯基极易被氧化,需与卤化烷试剂作用将其保护。五、氨基酸的光学活性和光谱性质 143页 氨基酸的旋光性 氨基酸的光谱性质消旋作用(外消旋物与内消旋物)氨基酸的光谱性质 145页 可见光区都没有光吸收 红外区和远红外区都有吸收(200nm) 近紫外区(200nm400nm)色氨酸280nm酪氨酸275nm苯丙氨酸257nm练习题 所有氨基酸都是构成蛋白质的组分。
25、在下列氨基酸中碱性氨基酸是:A. Ser B. Lye C. Clu D. Tyr 必需氨基酸有: 氨基酸在等电点时,主要以_ 离子形式存在,在pHpI的溶液 中,大部分以_离子形式存在。 一个蛋白质样品经酸水解后,能用氨基酸自动分析仪准确测定它的所有氨基酸。 下列氨基酸溶液除哪个外都能使偏振光发生旋转?A. Aal B. Gly C. Leu D. Ser 在生理pH条件下。具有缓冲作用的氨基酸残基是 A. Tyr B. Trp C. His D. Lys 在生理条件下(pH6.0-7.0左右), _氨酸侧链和_氨酸侧链几乎完全带正电荷。 在近紫外区(200nm400nm)具有吸收能力的氨基酸有: 实验室中常用打开二硫键的试剂有:六、氨基酸混合物的分析分离