核磁处理软件使用说明.ppt

Mestre－C WINNMR,核磁处理软件,核磁数据处理软件 有：NUTS、MestRe-C、Gifa等； NUTS可以处理一维及二维核磁数据，其功能包括付立叶变换、相位校正、差谱、模拟谱、匀场练习等几乎所有核磁仪器操作软件的功能；其演示版在http://www.acornnmr.com下载,MestRe-C为处理一维二维核磁数据的免费软件，功能完善。其最新版本为2.3，有兴趣可在 http://qobrue.usc.es/jsgroup/MestRe-C/MestRe-C.html处查看有关信息即下载；或所内网站上下载； Gifa可以处理一至三维核磁数据，为运行在LINUX操作系统中X-Window上的免费软件，有关信息可查看http://www.cbs.univ‑montp1.fr/GIFA,核磁处理软件,Mestre－C,软件安装,从ftp上下载软件，安装完毕后，将crack软件解压缩后将其拷贝到安装程序所在文件夹，覆盖原文件即可,获取核磁数据,软件本身带有一个ftp客户端软件 可以从网络下载数据,打开已经下载的数据,软件可以自动识别核磁数据的格式（不同仪器产生的数据格式不同） 对于所有的仪器，原始的核磁数据文件名为fid 对于bruker仪器产生的数据，因其可以保存处理好的数据，可由Mestre-C软件直接打开，文件名1D为 1r，2D为 2rr,核磁数据的目录结构,Bruker仪器： 文件名\编号\，原始数据存储在这个文件夹中 File\open\文件所存盘\文件名\样品编号\pdata\处理编号\文件类型(all files)\文件名1D为 1r，2D为 2rr ，处理过的数据存储在这个文件夹中,一维数据处理的步骤,打开原始数据文件 fid文件，是一个递减的波形文件 进行傅立叶变换，设置参数，最重要的是set functions中的第一个参数（窗函数） 调整相位 基线校正 积分，定标，标记化学位移等,谱图处理－设置窗函数,单击ft按钮，在对话框中点击set function(s) 在打开的对话框中，修改exponentia的值 缺省是0.5Hz，增加此项数值将会是峰型变宽，但可消除裂分,相位校正,可选择自动相位校正 如果效果不好，可使用手动校正 点击手动相位校正按钮 在对话框中点击biggest按钮 在对话框中间部分按住鼠标左键，调整最高峰附近的峰的相位 在对话框中间部分按住鼠标右键，调整远离最高峰的其他峰的相位 调到峰行对称,基线校正,点击工具按钮上基线校正按钮，在菜单中选择full auto即可,核磁画图,可以不做以上操作直接进入图谱按以下操作 进行图谱处理。,１Ｄ处理 　　标记峰 　　定标 　　积分 　　谱图显示 ２Ｄ处理,标记峰,找出变换好的图谱路径如下： File\open\文件所存盘\文件名\样品编号\pdata\文件类型（所有文件all files）\文件名1D为 1r，2D为 2rr 1D点击Peak Picking按钮，使用鼠标在谱图中进行标记,点击Peak Picking按钮，使用鼠标选中（框住）在谱图中进行标记,化学位移保留小数点后３－５位：options/properties/peak pick/decimal,,定标,如果化学位移出现偏差，可使用工具条上标 有TMS的按钮进行定标： 单击TMS按钮，鼠标指针变为十字型 在标准峰上单击鼠标 在弹出的对话框中输入化学位移值,积分,点击积分按钮，使用鼠标进行积分 可使用自动积分 积分值可以到出到文件,点击积分按钮，按住鼠标左键拉动进行积分,用鼠标双击某一积分面积跳出对话框把它定为1对积分面积进行调整，后copy到word,鼠标拉倒边框处，点右键对边框进行调整,,,谱图显示,可使用工具按钮上有关谱图显示的按钮进行谱图放大，缩小等操作,Mestre-C有关参数的设置,窗口背景，options－》seting 谱图参数，options－》properties 找出变换好的图谱路径如下： File\open\文件所存盘\文件名\样品编号\pdata\文件类型（所有文件all files）\文件名1D为 1r，2D为 2rr,2D 处理,2D粘贴1D：从上面图标上点击setup 1D Traces 再从跳出的 对话框中点击lead from disk选择1D查找范围，样品所在， 样品名，图谱编号pdat/1r双击。,调整1d：如图按左边对话进行调整。,,2D校正：advance/ shift spectrum vector/ points to 增减。 添加方框线：options/ setting/ gride. 选为黑色,画图：选择从上面图标上点击红色方框，再从跳出的对话 框中点击红色方框图旁边的第二个圆圈图。,,2D去边框：　　粘贴好1D后，选中1D上边（或左边），点击鼠标右键/properties/set/none/ok/apply/ok,,,,NOESY, QC需要照以下路径操作： 　　界面左边lev/negative 调为０（＋／－） 2D去边框： 　　粘贴好1D后，选中1D上边（或左边），点击鼠标右键/properties/set/none/ok/apply/ok,C 和DEPT,依次打开C和 DEPT； 将C谱取峰，校正，确定C谱范围； 将DEPT打开，并确定成与C谱相同范围 将C谱复制edit/copy spectrum 在打开的DEPT中将复制的C谱粘贴 在工具栏stack 随后通过工具栏“左右居”中将两张谱对齐 以下操作类推即可，此时需用edit/select all spectrum 工具选择所用图谱，然后再copy,核磁处理软件,WINNMR,网络版WINNMR软件,从ftp上下载该软件 在安装界面中选择安装： WINNMR 1D：1D Post processing WINNMR 2D：2D Post processing WIBu key 2.52asoftware protection 安装完后在c:\windows\d2nmr.init中加入 [settings] Network=1 Nethasp=1,网络版WINNMR软件,此软件对1D谱放大及DEPT画图较好。 找出变换好的图谱路径如下： File\open\文件所存盘\文件名\样品编号\1D为1r，2D为 2rr点开 1D点击Peak Picking按钮，使用鼠标在谱图中进行标记 添加图谱参数output/acpu从里面选择所需参数/show select/ok,标记峰图谱路径如下analysis/peapking/pc/ok;点击＊２／２对图谱调整添加图谱参数output/acpu从里面选择所需参数。,,analysis/peak picking/pc/ok/mouse pp框出所 需的峰/return analysis/Calibration/calibraic/return analysis/integration/点击积分按钮，使用鼠标左键右键把光标放到最小的峰上进行积分//return/yes 打印output/printer set up/set up/布局/横向/确定/ok (此设置好后即可）,标峰、校准及积分路径如下:,调整图谱,点击左边preview 鼠标左键选中图谱，向左拉动右边边框，再用鼠标左键选中参数栏，将其拖到图谱右边。 鼠标左键选中图谱，向上下、左右拉动边框，用鼠标点击*2/2调整图谱峰高。,打印: 点击preview/yes 选中参数把参数拖到适当位置print or edit/copy到word，点击界面左上角nmr zoom 进行放大,,C 和DEPT,按照氢谱做法打开碳谱，进行校准标峰后点击preview双击鼠标左键跳出对话框把xstar和Xstop化学位移固定，把颜色改为黑色点击ok，再file/save metafile/确定/yes储存，return。 照上述操作打开dept/preview/调整图谱放在中间，删除参数，双击取消axis、fram ，选定star、stop/ok/在file/open metafile/确定 调整13C/save metafile/确定/yes,File\open\文件所存盘\文件名\碳谱编号\1r analysis/peak picking/pc/ok/mouse pp框出所需的峰/,点击preview双击鼠标左键跳出对话框把xstar和xstop化学位移固定,,固定谱宽化学位移,,鼠标左键选中图谱，向左拉动右边边框，再用鼠标左键选中参数栏，将其拖到图谱右边。鼠标左键选中图谱，向下拉动上边边框，缩小到页面1/3处，用鼠标点击*2/2调整图谱峰高。,鼠标,,,,,照上述操作打开dept/preview/调整图谱放在中间，删除参数，双击取消axis、fram ，选定star、stop固定化学位移/ok/在file/open metafile/确定 调整dept/save metafile/确定/yes,*2/2调整谱峰度,拉大、缩小边框,,,,选中取消,,,照上述操作打开dept135/preview重复上述操作/open metafile/确定 调整13C/print or copy到,2D处理,找出变换好的图谱路径如下： File\open\文件所存盘\文件名\样品编号\2rr 粘贴1r图谱路径如下： Utilities/f1-axis ext/ 文件所存盘/文件名/样品编号/pdata处理编号/文件类型(all files)/1r/accept Utilities/f2-axis ext/ 文件所存盘/文件名/样品编号/pdata处理编号/文件类型(all files)/1r/accept,可以拉大边框对图谱大小调整，拉后要选中上边和左边的1d调整，点击右面automatic factor改为2调整画面。,,放大图谱只要用鼠标框中2d在点击鼠标左右键,然后分别用鼠标点击上边和左边的1d调整，通过点击一边把一边变为灰色，另一边变为蓝色进行调整（灰色不变，蓝色变）。,,打印要把右面colors设置为黑色,,对于2d(hsqc、roesy)需要点击左上角＋/－对正负面选择恰当的一面进行处理。下图为点击＋/－前,,处理前图谱不理想，处理后较好图谱，下图为点击＋/－后,,打印设置,要把打印output/printer set up/set up/布局/横向/确定/ok (一此设置好后即可）或者在preview里面output/printer set up/set up/布局/横向/ok (一此设置好后即可） 要点击colors/monochrom变为黑色,Mestre－C软件对２Ｄ图谱处理较为方便。 网络版WINNMR软件对１Ｄ图谱处理较为方便，特别适用ＤＥＰＴ图谱的处理，该软件只 能在所内区域网上使用。,