1、Comment LU1: 不精炼hTERT shRNA表达质粒的构建及鉴定胡凡果 1，史玉荣 2，牛瑞芳 2，刘彤 1，只向成 3（1 天津医科大学总医院普通外科 300000；2 天津医科大学附属肿瘤医院中心实验室 300000；3 天津医科大学附属肿瘤医院乳腺三科 300000）通讯作者：只向成 摘要 目的 构建针对人端粒酶催化亚基 hTERT的 shRNA表达质粒并加以鉴定。 方法 以具有 G418抗性的 pBAsi-hU6-Neo（ BamHI/Hind）质粒构建针对 hTERT的 shRNA表达载体，应用基因测序加以验证。经脂质体转染 shRNA质粒入乳腺癌 T47D细胞，抗生素 G
2、418筛选转染成功的细胞株。采用半定量 RT-PCR及 western blot法检测细胞中 hTERT在 mRNA和蛋白质水平上的表达；TRAP-ELISA法检测细胞的端粒酶活性变化。结果 成功构建了 5种针对 hTERT的 shRNA质粒，经测序验证无误。将质粒转染入 T47D细胞后经 G418筛选获得了稳定转染的细胞株，hTERT 基因在 mRNA和蛋白水平的表达明显降低，端粒酶活性出现显著下降。 结论 质粒 pBAsi-hU6-Neo（ BamHI/Hind）可用于构建hTERT shRNA表达载体,可转染到乳腺癌 T47D细胞，并能显著降低 hTERT基因mRNA和蛋白的表达，进而抑
3、制细胞端粒酶活性。主题词 端粒酶；人端粒酶逆转录酶；RNA 干扰；乳腺癌Construction and identification of hTERT-targeted shRNA-expressing plasmid HU Fan-guo, SHI Yu-rong, NIU Rui-fang, LIU Tong, ZHI Xiang-chengAbstract Objective To construct and identify a hTERT-targeted shRNA-expressing plasmid vector. Method The plasmid pBAsi-hU6-N
4、eo（BamHI/Hind）which is immune to antibiotic G418 was used to construct shRNA-expressing vector and identified by gene sequencing. Plasmid was transfected into breast cancer cell T47D with liposome and those cells expressing shRNA were selected by G418. RT-PCR and western blot were used to detect the
5、 expression of hTERT on mRNA and protein level. The telomerase activity was examined by TRAP-ELISA. Results 5 kinds of hTERT-targeted shRNA-expressing plasmid were successfully constructed, which was proved by gene sequencing, and they were introduced into breast cancer cell T47D. The expression of
6、hTERT decreased both on mRNA and protein level, and telomerase activity was inhibited at the same time. Conclusion The plasmid pBAsi-hU6-Neo（BamHI/Hind） can be used to construct shRNA-expressing vector and transfected into breast cancer cell T47D. The shRNA-targeted hTERT-expressing vector can inhib
7、it the expression of hTERT on both mRNA and protein level and then reduce the telomerase activity.key words telomerase; hTERT; RNAi; breast cancer端粒酶的活化与恶性肿瘤的发生、发展密切相关，通过激活端粒酶，端粒DNA 得以延长从而使细胞获得永生化。端粒酶逆转录酶（telomerase reverse transcriptase, TERT）是端粒酶的活性亚基，一般只在永生化细胞中表达 1，抑制其表达可明显降低细胞端粒酶活性 2。RNA 干扰技术（RN
8、A interference, RNAi）通过双链 RNA（double stranded RNA，dsRNA）产生序列特异性的转录后基因沉默，在哺乳动物细胞内可高效特异地阻断特定基因的表达 3，其沉默效果具有高效、特异、持久等特点，现已作为一种成熟的技术广泛应用于基因的沉默研究。本研究拟构建针对人端粒酶催化亚基 hTERT 的短发夹状RNA(short hairpin RNA, shRNA)表达质粒，使其在乳腺癌细胞 T47D 中稳定表达特异性 shRNA，检测其对 hTERT 基因表达和端粒酶活性的影响。材料与方法11 材料：质粒 pBAsi-hU6-Neo、各种限制性内切酶以及 cDNA
9、 第一条链合成试剂盒购自大连宝生物公司（TaKaRa） ；中量质粒提取试剂盒、PCR 反应预混Taq 酶 Colorless GoTaq Mastermix 购自 Promega 公司；转染试剂Lipofectamine2000TM、RNA 提取试剂 Trizol 为 Invitrogen 公司产品；G418 购自美国 Sigma 公司；hTERT 兔抗人多克隆抗体为 Santa Cruz 公司产品，HRP 标记的山羊抗兔二抗购自北京中杉金桥生物技术有限公司；ECL 化学发光试剂购自 Pierce 公司；TRAP-ELISA 端粒酶活性检测试剂盒购自罗氏公司；RPMI1640培养基、胎牛血清为
10、 Hyclone 公司产品；乳腺癌细胞 T47D 为天津医科大学附属肿瘤医院中心实验室保存。12 质粒的构建：根据 TaKaRa 公司 siRNA 的在线设计软件，针对编码 hTERT蛋白的 mRNA 序列（GenBank 序列号 NM 198253）设计合成 4 对针对 hTERT 基因的干扰核苷酸序列，分别对应于 mRNA 的 4 个不同部位，任意取其中一条链随机打乱核苷酸排列顺序作为阴性对照链，分别命名为siRNA1、siRNA2、siRNA3、siRNA4 和 siRNA2-Negative(siRNA2-N)。每条序列包括：两端酶切位点序列（BamHI/Hind） ，两条反向互补排列
11、的 19 个碱基的hTERT 特异序列，中间加上 loop 环 9 个核苷酸序列，作为终止信号的 6 个胸腺嘧啶核苷酸（表 1） 。将合成的 5 对序列用 TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice TP600 进行退火，使用 TaKaRa DNA Ligation Kit（Code No.D6022）中的Solution分别将退火产物与 pBAsi-hU6-Neo（BamHI/Hind）载体连接后，热转化至大肠杆菌 DH5 中，涂布于含链霉素的平板上，37过夜培养，分别从平板上挑取菌落，小量扩增后提取质粒，用引物 pBAsi-R：5-TGGCGAAAGGGGGATGTGCT
12、- 3进行测序，挑选测序结果正确的菌落在摇床上37过夜培养(250r/m)，按试剂盒说明提取纯化质粒。13 细胞培养、转染及筛选：复苏冻存的 T47D 细胞，用含 10%胎牛血清（fetal bovine serum , FBS）的 RPMI1640 培养基于 37、5%C0 2培养箱中培养，定期观察细胞生长状态，当细胞生长至融合度达 90%时传代至 12 孔板，至细胞生长至 80%融合度时进行质粒转染，按 Lipofectamine2000TM 转染试剂说明书操作。实验设正常细胞对照组、4 个实验组、1 个阴性对照组，每组细胞设三孔。转染后 6h，弃去转染液，更换为 10%FBS 的 RPM
13、I1640 培养基。48 小时后更换为含有 500ug/mlG418 的培养基，每 3 天左右更换一次，每天观察细胞生长情况，20 天左右可见抗性细胞克隆形成，以维持浓度 250ug/ml 的 G418 培养基扩增培养。14 RT-PCR检测hTERTmRNA的表达：采用Trizol一步法提取细胞总RNA，取1ugRNA进行逆转录，按试剂盒说明操作合成cDNA。PCR按Promega公司预混的Taq酶Colorless GoTaq Mastermix说明书操作进行，特异性hTERT扩增的正向引物序列为：5-GAGTGTCTGGAGCAAGTTGCAAAG-3,反向引物序列为：5-CACGACG
14、TAGTC CATGTTCACAATC-3，扩增片断187bp。特异性-actin扩增的正向引物序列为：5-ATCTTCAAACCTCCATGATG-3，反向引物序列为：5-ACCCCCACTGAAAAAGATG A-3，扩增片段136bp。反应条件为：955min灭活逆转录酶，95变性30s，61退火30s，72延伸20s，共35个循环，最后72再次延伸10min。取10ulPCR产物行2%琼脂糖凝胶（含EB0.5ug/ml）电泳，凝胶成像仪分析，mRNA表达量比较用目的条带的吸光度值与内参照条带的吸光度值之比做对比。1.5 western blot 检测 hTERT 蛋白的表达：收集经 G
15、418 筛选的细胞，PBS 缓冲液洗涤细胞 2 遍以细胞裂解液（RadioImmunoPrecipitation Assay,RIPA）裂解细胞，冰上放置 30min，4，12000g 离心 20min，取上清进行蛋白质定量，取 50ug 蛋白质加入 2上样缓冲液，经 1005min 变性后用 8%的十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE） ，以转膜仪（大连竞迈生物）将蛋白质半干转至 PVDF 膜（Pierce）上，用含 8%脱脂奶的 TBST 缓冲液室温封闭 2h，加入1：500 稀释的 hTERT 一抗（兔抗人 IgG 多克隆抗体，Santa Cruz）室温孵育2h，TBST
16、 洗涤 3 次，每次 10min，加入 1：3000 稀释的二抗（辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔 IgG，北京中杉金桥生物技术有限公司）室温孵育 1h，TBST 洗涤三次，然后加入 ECL 化学发光底物（Pierce 公司产品） ，暗室中 X 光胶片曝光 2min，以曝光条带的灰度值分析 hTERT 蛋白的表达量高低。同时设立 -actin 为内参照。1.6 端粒酶活性测定：采用以 PCR 法为基础的 TRAP-ELISA 法检测端粒酶活性，按试剂盒 TeloTAGGG Telomerase PCR ELISAPLUS（Cat.No.12013789001,Roche）说明操作。端粒酶活性按试剂
17、盒说明书提供的公式计算，以 RTA(Relative Telomerase Activity)表示。1.7 统计学方法：统计学分析采用 SPSS13.0 软件，两组间比较采用两个独立样本的 t 检验。结果2.1 hTERTshRNA 的质粒构建和鉴定：测序结果显示，hTERT 基因的 5 条 shRNA双链均成功地与质粒 pBAsi-hU6-Neo 连接（图 1-图 5） 。2.2 转染后 hTERTmRNA 表达的变化：hTERTshRNA 质粒 DNA 转染 T47D 细胞后，各组 hTERTmRNA 表达量变化不一，siRNA1 和 siRNA2-N 组变化不明显，而siRNA2、siR
18、NA3 和 siRNA4 组则明显降低，以 siRNA4 组下降最为明显（图 6） 。经灰度值比较计算，同 T47D 对照细胞相比， siRNA2 组下降 57.1%（P0.05） ，siRNA3 组下降 53.7%（P0.05） ，siRNA4 组下降 70.0%（P0.05） 。2.3 转染后 hTERT 蛋白的表达变化：hTERTshRNA 质粒 DNA 转染 T47D 细胞后，siRNA1 和 siRNA2-N 组 hTERT 蛋白的表达变化不明显，而 siRNA2、siRNA3 和siRNA4 各组则明显降低，以 siRNA4 组下降最为明显（图 7） 。灰度值比较显示，同 T47D
19、 对照细胞相比，siRNA2 组下降 57.0%（P0.05） ，siRNA3 组下降53.4%（ P0.05） ，siRNA4 组下降 70.3%（P0.05 ） ，同 mRNA 下降水平基本一致。2.4 转染后端粒酶活性的变化：同 T47D 对照细胞相比，转染 hTERTshRNA 质粒后 siRNA1 和 siRNA2-N 组细胞相对端粒酶活性（Relative Telomerase Activity，RTA）下降不明显，而 siRNA2、siRNA3 和 siRNA4 组则分别下降57.0%（ P0.05） 、56.5%（P0.05）和 81.9%（P0.05） （图 8） 。可见si
20、RNA2、siRNA3 和 siRNA4 都能不同程度的降低 T47D 细胞的端粒酶活性，其中仍以 siRNA4 的干扰作用为最强，这同 hTERTmRNA 和蛋白变化水平相一致。讨论端粒酶是一种具有逆转录酶活性的核糖核蛋白，人的端粒酶核心成分为人端粒酶RNA（human telomerase RNA，hTR）、人端粒酶相关蛋白(human telomerase associated protein，hTP)和人端粒酶逆转录酶(human telomerase reverse transcriptase，hTERT)。其中hTERT为端粒酶的活性亚基，它可以在hTP的帮助下以hTR为模板，不断
21、逆转录合成重 复 序 列 （ TTAGGG）并 结 合 到 端粒 DNA上使之延伸，从而解决了真核细胞分裂中的末端复制问题。如果细胞内端粒酶活性异常表达，就会使细胞获得“永生性”，进而转化为癌细胞 4-6。因此hTERT在端粒酶导致细胞永生化过程中起重要作用，也是端粒酶的限速步骤。Indran IR等 7研究发现，肿瘤细胞中hTERT的过表达可以通过增强细胞的抗氧化防御系统而降低细胞内的活性氧簇（reactive oxygen species，ROS）水平，进而加强了线粒体的功能，结果使肿瘤细胞避免ROS介导的细胞凋亡。研究者将正常人3号染色体导入肾癌细胞系Rcc23，发现其端粒酶活性降低，端
22、粒缩短，细胞出现衰老，研究证实端粒酶活性的抑制是由于hTERT基因表达下调引起的 8。上述研究表明hTERT作为端粒酶的催化亚基与恶性肿瘤Comment LU2: 这些都是人所熟知的，不必赘述的发生发展密切相关，可以作为肿瘤治疗研究的理想靶点，本研究即选择hTERT作为靶向基因。RNA干扰是自然界生物体的一种遗传现象，是一种由dsRNA介导的序列特异性转录后基因沉默过程。当外源性dsRNA进入细胞后，被 RNase 蛋白家族成员之一的Dicer酶所识别，并被切割为2123个核苷酸的短双链RNA，即siRNA。siRNA与RNA介导的沉默复合体（RNA induced silencing com
23、plex, RISC）结合后，识别并降解同源的mRNA，从而特异性抑制目的基因的表达，具有高效、特异的特点 39。RNA干扰自发现以来，已广泛应用于基因功能、肿瘤和艾滋病、乙肝等病毒性疾病的治疗等研究 10-14。siRNA可通过直接化学合成或体外转录产生，也可以通过体内转录形成shRNA进而产生。化学合成siRNA简便快捷，但是存在转染效率低，时效短等缺点。目前常利用质粒或病毒载体体内表达siRNA，该法通过转染含有RNA酶启动子U6或H1及其下游一小段特殊结构的质粒或病毒载体到宿主细胞体内，转录出shRNA，shRNA在胞内被Dicer酶剪切成siRNA而发挥作用 9。该方法的优点是转染后
24、经过筛选可以获得稳定转染的细胞，从而解决了转染效率低的问题，并且适用于长时间的干扰研究和动物试验，因此我们选择构建能表达shRNA的质粒载体进行RNA干扰研究。本研究以端粒酶的活性亚基 hTERT为靶点，设计了 5种针对 hTERT的siRNA（一种为阴性对照） 。选择质粒 pBAsi-hU6-Neo作为载体，成功构建了 5种能表达针对 hTERT的 shRNA质粒载体，经测序验证无误，借助脂质体转染试剂 Lipofectamine2000TM把 5种质粒分别转染到乳腺癌 T47D细胞，经 G418筛选后获得了稳定表达 siRNA的细胞，检测发现五种 siRNA中有三种能明显抑制hTERT的表
25、达，其 mRNA和蛋白水平明显下降，相应的细胞端粒酶活性明显降低，而另外一种 siRNA和阴性对照组对 hTERT则无明显的抑制作用。我们的研究表明质粒 pBAsi-hU6-Neo可以作为表达 shRNA的载体，因其携带氨苄抗性基因和G418抗性基因，利于转染后细胞的筛选；其次，根据 hTERT不同基因位点设计的 siRNA干扰效果迥异，表明 RNA干扰的效果与基因位点的选择密切相关。总之，针对 hTERT的 shRNA表达载体能显著降低 T47D细胞端粒酶活性，其对细胞周期分布、增殖能力可能也存在着相应影响，进而有潜力应用于肿瘤的基因治疗研究。参考文献1Kim NW, Piatyszek M
26、A, Prowse KR,et al. Specific association of human telomerase activity with immortal cells and cancerJ. Science, 1994 Dec 23; 266 (5193):2011-5.2Janknecht R. On the road to immortality: hTERT upregulation in caner cellsJ. FEBS Lett, 2004, 564(1-2): 9-13.3Hammond SM, Bemstein E, Bench D, et a1. An RNA
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29、nd inhibits ROS-mediated apoptosis in cancer cellsJ. Cancer Res. 2011 Jan 1;71(1):266-76. 8Ying Cao,He Li,Deb S, et a1. TERT regulates cell survival independent of telomerase enzymatic activityJ. Oncogene, 2002, 21:31309安立峰，董震。RNA 干扰肿瘤研究的新工具J。中华肿瘤杂志，2005，27：385-388.10Wicklein D. RNAi Technology to B
30、lock the Expression of Molecules Relevant to Metastasis: The Cell Adhesion Molecule CEACAM1 as an Instructive ExampleJ. Methods Mol Biol,2012;878:241-50.11Baudet A, Karlsson C, Safaee Talkhoncheh M, et al. RNAi screen identifies MAPK14 as a druggable suppressor of human hematopoietic stem cell expan
31、sionJ. Blood, 2012 May 3. 12Bora RS, Gupta D, Mukkur TK, et al. RNA interference therapeutics for cancer: Challenges and opportunities (Review)J. Mol Med Report, 2012 Jul;6(1):9-15.13von Eije KJ, Berkhout B. RNA-interference-based gene therapy approaches to HIV type-1 treatment: tackling the hurdles
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33、CCGCATTGGAATCAGACAGCACTGTGAAGCCACAGATGGGTGCTGTCTGA TTCCAATGCTTTTTTA 3R: 5-AGCTTAAAAAAGCATTGGAATCAGACAGCACCCATCTGTGGCTTCACAGTGCTGTCTGATTCCAATGCG 3siRNA2F: 5-GATCCGGAACTTGCTAACGCAAGACTGTGAAGCCACAGATGGGTCTTGCGTTAGCAAGTTCCTTTTTTA 3R: 5-AGCTTAAAAAAGGAACTTGCTAACGCAAGACCCATCTGTGGCTTCACAGTCTTGCGTTAGCAAGTTCC
34、G 3siRNA3F: 5-GATCCGTCAGACAGCACTTGAAGAGCTGTGAAGCCACAGATGGGCTCTTCAAGTGCTGTCTGACTTTTTTA 3R: 5-AGCTTAAAAAAGCATGGACTACGTCGTGGGACCCATCTGTGGCTTCACAGTCCCACGACGTAGTCCATGCG 3siRNA4F: 5-GATCCGCACTTCCTCTACTCCTCACTGTGAAGCCACAGATGGGTGAGGAGTAGAGGAAGTGCTTTTTTA 3R:5-AGCTTAAAAAAGCACTTCCTCTACTCCTCACCCATCTGTGGCTTCACAG
35、TGAGGAGTAGAGGAAGTGCG 3siRNA2-NF: 5-GATCCGCATGGACTACGTCGTGGGACTGTGAAGCCACAGATGGGTCCCACGACGTAGTCCATGCTTTTTTA 3R: 5-AGCTTAAAAAAGTCAGACAGCACTTGAAGAGCCCATCTGTGGCTTCACAGCTCTTCAAGTGCTGTCTGACG 3图 1 siRNA1 质粒测序结果CCAAGCTATCGATATCAAGCTTAAAAAAGCATGGACTACGTCGTGGGACCCATCTGTGGCTTCACAGTCCCACGACGTAGTCCATGCGGATCCTCGTCCTTTC图 2 siRNA2 质粒测序结果GCCAAGCTATCGATATCAAGCTTAAAAAAGCATTGGAATCAGACAGCACCCATCTGTGGCTTCACAGTGCTGTCTGATTCCAATGCGGATCCTCGTCC图 3 siRNA2-N 质粒测序结果GCTATCGATATCAAGCTTAAAAAAGGAACTTGCTAACGCAAGACCCATCTGTGGCTTCACAGTCTTGCGTTAGCAAGTTCCGGATCCTCGTCCTTTC
