1、第二节 英文数据库 pubmed（文摘数据库）,有三种版本：印刷版Index Medicus 简称（IM） 光盘版MEDLINE数据库网络版PubMed检索系统,一、美国医学索引,美国医学索引印刷版 Index Medicus 简称IM，是美国国立医学图书馆编辑出版的、世界上最负盛名的医学文献检索工具。包括题录,文摘及部分全文。学科覆盖 基础医学 临床医学 职业卫生 护理学 卫生管理 卫生保健 营养卫生 齿科学 环境医学 情报学 药理和药剂学 兽医学,美国医学索引的光盘版MEDLINE数据库 是当前国际上最具权威性的生物医学文献数据库。,特点： 1、报道的文献量大、质量高 国家: 70多个 语
2、种: 40多种 期刊: 4700多种 文献: 年报道量40多万篇 英文发表量: 88% 英文文摘量: 75% 我国被收期刊: 50多种 可检索年限为: 1946年至今,2、标引的质量高、检索效果好： 它的编撰队伍由医学专家和图书馆学专家组成， 有一部完善的主题词表，能保证较高的检全率和 检准率，其标引质量之高堪称现代检索工具的典范。,美国医学索引的网络版PubMed数据库 是MEDLINE数据库的网上免费检索系统，它是由美国国立医学图书馆（National Library of Medicine，NLM ）所属的美国生物技术信息中心（National Center for Biotechnol
3、ogy Information，NCBI）开发研制的网络文献检索系统。并有许多期刊出版商参与共建。,PubMed特点,1、资源丰富。 （1）Medline数据库 -PubMed （2）Premedline数据库 - PubMed - in process （3）出版商提供的电子文献-PubMed - as supplied by publisher （4）NCBI其它数据库的相关记录 （5）收录5600多种期刊，年新增60余万条文献，可检索年限为1865年 至今。2、提供多种检索方式。3、为检索结果提供多种的显示格式和保存方式。4、LinkOut功能可以链接免费的全文期刊。5、报道速度比MED
4、LINE更快，内容更新。,常用资源,NCBI数据库平台http:/www.ncbi.nlm.nih.gov,提交,研究,发展,分析,下载,帮助,资源分类,通知,包含的子库,NCBI介绍,生物医学文献数据库,免费期刊全文文献,NLM收录的图书、期刊等目录,在线生物医学图书,Pubmed的主题索引,临床疗效，疾病和药品报告,医学遗传学文献及链接,基因检测注册表,基因型和表型研究,孟德尔人类遗传数据库,基因测试序列记录库,核酸序列数据库,基因组数据,基因,蛋白质,结构,蛋白质序列,族姓蛋白质,进入了完整的数据库群平台,点击数字可进入相应数据库的结果页面,跨库检索,Mers 中东呼吸综合征,相关新闻提
5、示,入口1入口2,检索框,Pubmed数据库进入,专项检索区,相关数据库,使用帮助,Pubmed首页,检索区,检索方式,1、简单检索2、高级检索3、主题检索4、作者检索自学5、期刊检索自学6、刊物信息检索自学7、单篇引文匹配器检索自学,1、简单检索-直接输入检索词（式）检索,4,Aids注：此处支持布尔逻辑检索,显示格式:默认格式为 Summary格式，每页显示20条记录，按最近加入系统的日期排序,结果总数,篇名字段,作者字段,刊名及刊期字段,条目识别号PMID,检索结果显示页面,检索结果按年份柱状图,限定条件,文献内容类型,文本类型,检索范围,出版时间,物种类型,Show additiona
6、l filters更多限定条件（检索字段、年龄、语种等限定）,题录格式题录文本文摘格式文摘文本MedlineXML格式PMID列表,格式,检索结果格式设置,排序方式,最近添加相关度出版日期第一作者最后一个作者期刊名称题名/篇名,设置格式为：Abstract,题名,作者,作者单位、地址、电子邮箱,刊名，刊期,abstract文摘,Keywords关键词,Abstract 比Summary格式多了作者单位、地址、邮箱、文摘、关键词、全文图标等字段,Medline格式,字段缩写，全称对应见教材P147,此格式的特点是:字段分解的特别详细,检索标识丰富，每个字段都是一个信息点。,检索结果保存方式,Se
7、nd to结果保存,文档txt我的ncbi订购下载到文件管理系统,剪贴板电子邮件我的目录,1、建立自己的NCBI空间，需要进行注册。点击右上 角的 Sign in to NCBI，在打开的页面注册即可。 可用来保存检索式，定期跟踪最新研究内容。2、剪贴板可保存500条记录，8小时候自动清除。,注册,Link Out-链接功能,提供全文链接、其它库的链接,检索原理,系统将检索词在主题词表、刊名转换表、作者转换表间进行自动转换，然后检索。,aids,Search details具体检索式： acquired immunodeficiency syndromeMeSH Terms OR (acqui
8、redAll Fields AND immunodeficiencyAll Fields AND syndromeAll Fields) OR acquired immunodeficiency syndromeAll Fields OR aidsAll Fields,2、高级检索-Advanced,点击进入,检索输入框,检索字段,标引词汇列表,逻辑运算符,检索历史,Add to history预检索,检索式编号,添加进检索框,之前的检索式,检索结果数量,检索时间,增加/减少检索框,标引词汇列表：可以根据提示及检索结果数量，直接选择检索内容,Show index list,heart,显示前2
9、00个与heart相关的检索内容及文献数量,Heart(1064172),例：检索2015年在Journal of clinical imaging science期刊上发表的题名中含有磁共振成像的文献。,分析题目：检索点：出版时间-2015年 期刊名称-Journal of clinical imaging science 题名-磁共振成像 MRI OR Magnetic Resonance Imaging逻辑关系: AND，同时含有所有点检索方法：用高级检索方式， 检索题名中含有磁共振成像的文献， 再分别输入出版时间、期刊名称及 history中 磁共振成像的检索式， 然后完成检索。,预检
10、索,题名（title）,逻辑关系,MRI Magnetic Resonance Imaging,83880,出版时间(Date-publication),期刊名称(Journal),逻辑关系,8篇，点击进入结果页面,免费全文,高级检索特点,可以从标引词汇列表中选择检索词。可以进行预检索，根据检索结果数量，再调整检索式直到结果满意为止。复杂检索时，可以通过先单个检索，再组合形成完整的检索式进行检索的方式。,3、主题检索,入口1 2,主题检索是将检索词转换为系统标引的主题词进行的检索。保证较高的查全率和查准率。省时省力。,使用指南,更多资源,主题词检索与自由词检索的区别,肾衰竭/肾衰-肾功能衰竭
11、自由词 主题词阿尔茨海默病/老年痴呆/AD-阿尔茨海默病 自由词 主题词 用主题词检索可以一次完成所有自由词的检索， 而用自由词则要分多次才能完成整个检索。,NLM MeSH Homepage主题词库首页,进入主题词检索页面的步骤,MeSH Browser主题词浏览,MeSH Browser主题词检索页面,主题词字段Main Heading Terms,副主题词字段,补充概念字段,所有字段,Mesh数据库的标识码,化学物质检索限定如下字段,注释中自由词,方法二：直接输入检索词,方法一：树状导航,包含检索词中任一词,包含所有词,精确检索,方法一、树状结构导航,解剖,有机体,疾病,化学品与药物,地
12、理,出版特征,卫生保健,命名群组,信息科学,人文科学,科技、工业、农业,人类学、教育、社会学与社会现象,学科与职业,现象与操作,精神病学与心理学,分析、诊断、治疗技术与设备,例：查找乳腺癌的主题词,NeoplasmsC04+肿瘤,树状结构号，标示该词在树状结构中的位置,Breast Neoplasms乳腺癌,Neoplasms by Site肿瘤按部位分,下位词,同位词,上位词,NeoplasmsC04+肿瘤,Breast Neoplasms 主题词,方法二、输入检索例：检索糖尿病的主题词 （diabetes、diabetic、diabetes mellitus）,如果输入一个检索词检索后，出
13、现此类页面，说明输入的检索词不是该主题词的入口词。解决方法：1、更换其他的检索词重新检索；2、直接从此列表中辨别。,出现此表格页面，说明找到了检索内容的主题词。,Diabetes Mellitus 糖尿病的主题词,树状结构号,注释,范围说明,入口词,副主题词缩写,Mesh标识码,组合输入,标引时间,例：检索2009-2012年发表的题名或文摘中含有糖尿病的药物治疗方面的综述文献。,分析题目：1、检索点：出版时间：2009-2012年 检索主题：糖尿病的药物治疗 检索字段：题名或文摘（title/abstract） 文献类型：综述（review）2、检索方法：主题检索，先确定糖尿病的主题 词，再
14、选择副主题词“药物治疗”， 检索文献，最后限定条件再进行检索。,把确定好的主题词复制粘贴到Mesh框中,系统中有60个相关主题词或副主题词,糖尿病的主题词页面,副主题词，用来限定主题词，缩小检索范围,2、形成检索式(主题词/副主题词)后，再点击第二个按钮Search Pubmed,Search Pubmed,检索式：Diabetes Mellitus/drug therapyMesh格式：主题词 / 副主题词,1、选择所需副主题词,然后点击右侧第一个按钮Add to search builder,Drug therapy,Add to search builder,检索式,Pubmed中关于糖
15、尿病的药物治疗的文献数,选择条件，进一步缩小范围,限定条件,结果数量2792条,2009-2012年发表的题名或文摘中含有糖尿病的药物治疗方面的综述文献,三种检索方式对比：例题的简单检索,结果数量492条,检索式:(diabetes or diabetic or diabetes mellitus) and drug therapy,主题检索结果2792条,高级检索diabetes、diabetic、diabetes mellitus,选择检索字段Title/Abstract,选择Title/Abstract，输入drug therapy,将单个检索式组合起来,点击检索式前边的Add将检索式添
16、加到框中,结果数量98条,主题检索结果2792条,简单检索、高级检索、主题检索比较,简单检索，使用方便，但查全查准率低。高级检索，适合复杂问题的检索，可以通过单个检索式组合的方式完成复杂问题的检索，且可以进行预检索，根据结果数量调整检索式。主题检索，过程略显复杂，但可程序化操作，熟练后也可以快速完成复杂问题的检索，较其它两种检索方式省时、省力。查全率、查准率最高。,免费获取全文的方法,可利用学校购买的数据资源，在校园网内免费下载；如果数据库中未购买的文献，可使用读秀、百链搜索进行原文传递；若不能使用学校资源，可到“图书馆”网站中“读者指南”中下载“文献传递申请单”，填写文献篇名、作者、出处等文
17、献详细信息发送email到，图书馆来代为文献传递。,课堂总结,数据库的定义及类型中文数据库：CNKI、SINOMED数据库的 各种检索方法及功能英文数据库：Pubmed的检索利用,作 业,每个班按学号分4个小组（12/24/36/） 完成对应的题目要求： 根据题目举例完成本组题目的讲解，将解题过程制作成PPT，下次课分组汇报（随机选择汇报人），限时5分钟/组。 PPT中先讲明本组的题目，然后开始讲解题过程。老师进行评分，计入平时成绩（占总成绩20%）。,注意：认真阅读本次上课的课件和自学课件后，再进行作业,1、万方数据库的高级检索。2、highwire数据库的高级检索。3、维普的核心期刊查找 。4、利用维普、CNKI查找文献的页码。5、维普数据库的初级、高级检索。6、万方数据库的专业检索。7、ovid数据库的简单检索、多字段检索。8、pubmed数据库的作者检索及期刊检索。9、利用维普查找参考文献。10、维普数据库的期刊详细信息。11、 pubmed数据库的单篇引文匹配器 。12、利用CNKI、万方查找文献的被引频次。,注意：以例题的形式做ppt讲解，请勿直接下载网上的,
