.常见系统发育软件使用方法Xie Lei BJFU1 Paup MP流程: Mac准备nex文件(interleave和noninterleave均可) 存入新建文件夹拖入paup或用paup打开 execute log file cstatus tstatus hsearch define outgroup roottrees savetrees describetrees contree(save to file) save pictbootstrap(save tree file) print bootstrap treesave pict. stop log.PC版操作,可将附录批处理文件内容粘贴至nex文件后面,execute即可。2 Paup ML 流程:Mac准备nex文件(interleave和noninterleave均可) 存入新建文件夹拖入paup或用paup打开execute从modeltest软件中打开paupblock运算检测模型生成score file