草莓EST-SSR标记的开发与初步应用.doc

上传人:bo****9 文档编号:6052612 上传时间:2021-08-08 格式:DOC 页数:12 大小:39.50KB
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资源描述

论文摘要:从公共数据库中下载61, 731条草莓表达序列标签(EST),组装后得到系列非冗余EST 14, 948条,总长度为9, 969.35 kb,挖掘到1, 807个SSR,分布在1, 515条序列上,发生频率为10.14%,平均每5.52 kb出现1个SSR。其中,235条系列包含2个或2个以上SSR,76个SSR以复合形式出现。二核苷酸(794个SSR)和三核苷酸(795个SSR)是主要的类型,所占比例分别为43.94%和44.00%。AG/CT(691个)和 AAG/CTT(278个)在二、三核苷酸中占主导地位。利用这些序列,设计47对引物,对生产上主栽的3个日本品种进行多态性研究,44对引物有扩增产物,6对表现多态性。结果表明,从草莓相关EST数据库中开发的EST-SSR引物可行且有用,在草莓品种鉴定、种质资源分析、遗传作图等研究方面有广阔的应用前景。论文关键词:草莓,标记开发简单序列重复简称SSR,是一类由几个(多为1-6个)碱基为单位串联重复的DNA序列,表达序列标签简称EST,是来源于一定环境(正常生长或逆境胁迫等)一定组织(根、茎、叶、花、果等)一定长

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