RT-PCR引物设计原则和方法(共4页).docx

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RT-PCR引物设计原则和方法近刚开始做PCR,参考了很多与引物设计相关的帖子,结合自己使用primer5和oligo的体会,想谈谈自己设计引物的方法和步骤,恳请各位前辈指正。RT-PCR引物设计原则和方法在NCBI上搜索到该基因,找到该基因的mRNA,在CDS选项中,找到编码区所在位置,在下面的origin中,Copy该编码序列作为软件查询序列的候选对象。打开Primer Premier5,点击File-New-DNA sequence, 出现输入序列窗口,Copy目的序列在输入框内(选择As),此窗口内,序列也可以直接翻译成蛋白。点击Primer,进入引物窗口。此窗口可以链接到“引物搜索”、“引物编辑”以及“搜索结果”选项,点击Search按钮,进入引物搜索框,选择“PCR primers”,“Pairs”,设定搜索区域和引物长度和产物长度。在Search Parameters里面,可以设定相应参数。一般若无特殊需要,参数选择默认即可,但产物长度可以适当变化,因为100200bp的产物电泳跑得较散,所以可以选择300500bp。点击OK,软件即开始自

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