XCMS包用法1.前期准备数据类型:NetCDF, mzXML, mzData 。 所以首先需要把自己的文件通过相应的软件转化成这类文件。数据位置:因为xcms会记录下数据所在的位置,并且在数据分析过程中会来回从文件夹中读取数据。所以不要再随意改变数据所在的文件的位置。数据来源:来源不同的数据应当分开进行数据前处理。比如正离子和负离子模式下得到的数据,不同的洗脱梯度下得到的数据。数据存储:xcms可以根据数据所在的文件夹的来识别不同的数据组。比如你想研究某一药物在两组病人间的纵向效应(longitudinaleffect),然后你可以把你的两组数据分别存入命名为group A和groupB的文件夹,这样xcms可以识别这两个组。每个文件夹内你还可以继续细分,比如按时间day1,day2等等。xcms会自动给这些数据命名为groupA/day1, group A/day 2, 等等。 (所以这里你要根据你的数据组来把它们存入不同的文件夹)。如果这里描述的不清楚的话,我会在后面的例子里进一步说明。下面将会以一个详细的例子来分布解说xcms是如何处