1、研究生生物信息学教学 2016 年计划安排周次 日期 教学内容与进度 练习或教学任务安排 老师1 2-25 绪论、核酸与蛋白质数据库要求学生查阅文献了解生物信息学的发展历史和完成特定研究方向的进展综述;要求学生访问、尝试使用指定的重要核酸和蛋白质数据库吴忠道2 3-3 成对序列比对与相似序列搜索技术:要求掌握成对序列比对方法,学习掌握序列检索和相似性搜索等方法。学习掌握 BLAST吕志跃3 3-10 上机操作 单独上机操作,分小班讨论 孙希、黄艳4 3-17 基因组结构注释 熟悉 GO、KEGG 等资源。 胡旭初5 3-24 蛋白质序列特征分析与功能预测掌握 EXPASY 等系统的使用。 吕志
2、跃6 3-31 上机操作 单独上机操作,分小班讨论 吕志跃、黄艳7 4-7 分子系统发育分析与多序列比对掌握基本的系统发生树构建方法掌握系统发生树构建软件 PHYLIP李学荣8 4-14 Microarray 基因表达数据分析了解基因芯片的原理,熟悉基本的数据分析方法孙希9 4-21 miRNA 数据分析 了解 miRNA 数据分析的方法和 miRNA 靶基因的筛选和鉴定孙希10 4-28 比较基因组学 熟悉蛋白质分类数据库 CATH 与 SCOP;初步掌握相关软件,熟悉 SNP 分型技术与数据资源李学荣11 5-5 上机操作 单独上机操作,分小班讨论 李学荣、孙希12 5-12 系统生物学中
3、的动力学建模熟悉系统生物学的主要分析方法及了解基本建模方法孙小强13 5-19 基因组数据分析 以华支睾吸虫基因组为例,了解基因组分析黄艳14 5-26 转录组数据分析 以广州管圆线虫转录组为例,掌握转录组分析许莲、孙希15 6-2 生物信息技术的综合应用 胡旭初16 6-9 期末考试 进行课程设计答辩 吴忠道、吕志跃、胡旭初、李学荣、黄艳、孙希注 每周四下午上课,3 学时新教 404 室星期四 ,下午 810 节,新教 404 课室新教计算机房 208 室主讲教师:吴忠道教授()、吕志跃教授、李学荣教授、胡旭初副教授、黄艳副教授、孙希副教授,孙小强老师教学秘书:孙希(13760849136) ;教学助理:许莲(15814596992,QQ:835796493) 实验教学:何建璋(13609765522)