系统生物学复习题一、名词解释同源性（homology）：进化过程中源于同一祖先的分支之间的关系。在进化上或个体发育上的共同来源而呈现的本质上的相似性，但其功能不一定相同。直系同源：指的是 不同物种之间的某一部分具有的同源性，不是整个物种之间的对比，只是其中的某些基因序列 例如 蛋白质 的同源性，DNA序列的同源性。并系同源：同一个基因组中有不同功能的同源基因，通过基因组、基因复制等过程形成。分子钟：单位时间内同源蛋白质氨基酸顺序或DNA核苷酸序列取代的比率有根树和无根树：有根树是具有方向的系统发生树(phylogenetic tree)，包含唯一的节点，将其作为树中所有物种的最近共同祖先。把有根树去掉根即成为无根树。无根树是没有方向的，其中线段的两个演化方向都有可能。分子系统树：根据生物大分子的序列资料建立起来的、用图解法表示的、类似树状的分子进化模型。分子进化（molecular evolution）：生物进化过程中生物大分子的演变现象。主要包括蛋白质分子的演变、核酸分子的演变和遗传密码的演变。同源性搜索（Blast）：应用最广泛的序列相似性搜索工
