生物信息学分析9页.docx

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4、生物信息学分析 通过核苷酸序列数据库和基因序列同源性在线分析途径初步对Rv2029c基因进行分类整理。由于结核分枝杆菌耐利福平野生株与核苷酸序列数据库KEGG GENES中的结核分枝杆菌标准株H37Rv的匹配率为100%,以下对基因的分析按照结核分枝杆菌标准株H37Rv的数据库信息进行,即完全匹配的1020bp长度序列(本次提取基因中包含上下游引物等序列,较长,1346bp)。 4.1基本信息表1 基因基本信息条目Rv2029c基因名称PfkB定义6-磷酸果糖激酶 PfkB组织来源结核分枝杆菌耐利福平野生株功能参与醣酵解:将糖-1-P转化为糖-1,6-P功能类别参与中间代谢与呼吸作用 4.2基因组信息表2 基因组信息基因组结核分枝杆菌 H37Rv(标准株)基因长 1020bp氨基酸 339分子量 35401.4 Da等电点5.6648蛋白结构域(图3)1、FruK(果糖-1-磷酸激酶(FruK)和关联的果糖-6磷酸激酶(PfkB),位点13-

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