泥蚶EST-SSR引物的开发和遗传多样性评价【任务书】.doc

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1、 1 毕业论文 任务书 生物技术 泥蚶 EST-SSR 引物的开发和遗传多样性评价 一、研究目的和意义 从公用数据库中筛选微卫星位点,从而在微卫星重复序列的侧翼设计引物,然后利用筛选得到的可用微卫星引物对泥蚶遗传多样性进行初步分析 ,为泥蚶的选育及种质保护提供有用的微卫星分子标记。 泥蚶 EST-SSR引物的开发和遗传多样性评价 对于加速优良性状泥蚶品系的培育,解决泥蚶养殖的种质退化问题,实现泥蚶养殖业的健康与可持续性发展具有重要意义。 二、主要内容与基本要求: 主要内容:泥蚶 DNA提取;设计 SSR引物; 建立稳定、高效的 PCR扩增体系和扩增条件 ; PCR 扩增;琼脂糖凝胶电泳;聚丙烯

2、酰胺凝胶电泳;挑选出好的 SSR引物;对泥蚶的遗传多样性进行评价。 基本要求:提取的 DNA要在 1%的琼脂糖凝胶上跑出清晰的条带;筛选出的引物片段不小于 18; DNA、引物等物品尽量避免反复冻融,需低温保藏;配制琼脂糖凝胶时应彻底煮沸溶解;配制聚丙烯酰胺凝胶时注意做好防毒措施,避免有毒物质的污染传播。 三、计划进度: 2011.4-2011.5 查找相关文献资料,设计实验计划; 2011.6-2011.7 依据泥蚶 EST 库内检索到的 SSR位点设计引物; 2011.8-2011.11 探索 PCR 反应体系,并利用温度梯度 PCR 仪筛选引物的最适退火温度; 2011.12-2012.1 使用筛选好的引物对泥蚶群体进行遗传多样性分析; 2012.2-2012.3 整理实验数据,撰写毕业论文; 2012.4 论文最终定稿,答辩。 四、主要参考文献: 1 曾庆国 ,林志华 ,尤仲杰 .泥蚶 (Tegillarca granosa) GT 微卫星位点的筛选和性质鉴定 J.海洋与湖沼 ,2008,39(2):174-176. 2 战爱斌 .栉孔扇贝 (Chlamys farreri)微卫星标记的筛选及应用 D.中国海洋大学研究生 ,2007:29-67. 3 李晶晶 .两种双壳贝类和光棘球海胆微卫星标记的分离及特性研究 D.中国海洋大学研究生 ,2008:42-53.

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