精选优质文档-倾情为你奉上1. 2.CLUSTALX进行序列比对1.1. 将要用于构建系统进化树的所有到同一个fasta格式文件，注意：所有序列的方向都要保持一致 ( 5-3)。如图：2. 打开MEGA软件，选择Alignment - Alignment Explorer/CLUSTAL，在对话框中选择Retrieve sequences from a file, 然后点OK，找到准备好的序列文件并打开，如图：。3. 在打开的窗口中选择”Alignment”-“Align by ClustalX” 进行对齐，对齐过程需要一段时间，对齐完成后，最好将序列两端切齐，选择两端不齐的部分，单击右键，选择delete即可，如图：。4. 关闭当前窗口，关闭的时候会提示两次否保存，第一次无所谓，保存不保存都可以，第二次一定要保存，保存的文件格式是.meg。根据提示输入Title，然后会出现一个对话框询问是否是Protein-coding nucleotide sequence data, 根据情况选择Yes或No。最后出现一个对话框
