精选优质文档-倾情为你奉上RNA-seq数据差异表达分析方法的比较BMC Bioinformatics 2013, 14:91 doi:10.1186/1471-2105-14-91A comparison of methods for differential expression analysis of RNA-seq dataCharlotte Soneson () Mauro Delorenzi ()摘要说的背景是： “发现条件间差异表达的基因是理解表型变异的分子基础的一个有机部分。过去几十年中，DNA微阵列被广泛用于定量不同基因的mRNA丰度，更近期的 RNA-seq作为一个强有力的竞争者冒了出来。随着测序成本持续下降，可以想象使用RNA-seq做差异表达分析会迅速增加。为了探索可能性和解决这种 相对新型的数据提出的挑战，大量软件包特别为RNA-seq数据的差异表达分析开发出来了。”而本文的结果是：“我们广泛比较了RNA-seq数据的差异表达分析的7种方法。所有方法都可以在R框架下免费获得，并以一个计数矩阵作为输入，计数即每个样品中映射到每
