全基因组重测序数据分析(共17页).docx

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精选优质文档-倾情为你奉上全基因组重测序数据分析1. 简介(Introduction)通过高通量测序识别发现de novo的somatic和germ line 突变,结构变异-SNV,包括重排突变(deletioin, duplication 以及copy number variation)以及SNP的座位;针对重排突变和SNP的功能性进行综合分析;我们将分析基因功能(包括miRNA),重组率(Recombination)情况,杂合性缺失(LOH)以及进化选择与mutation之间的关系;以及这些关系将怎样使得在disease(cancer)genome中的mutation产生对应的易感机制和功能。我们将在基因组学以及比较基因组学,群体遗传学综合层面上深入探索疾病基因组和癌症基因组。实验设计与样本(1)Case-Control 对照组设计 ;(2)家庭成员组设计:父母-子女组(4人、3人组或多人);初级数据分析1数据量产出: 总碱基数量、Total Mapping Reads、Uniquely Mapping Reads统计,测序深度分析。2

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