生物计算技术第4章多重序列比对分析ppt课件.ppt

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Biocomputing technology Multiple sequence alignment 第4 章 多重序列比对分析 目的要求: 1 掌握多重序列比对 的基本概念及意义 。 2 掌握多重序列比对 的星形比对 、树 形比对 及隐马 尔可夫模型。 3 了解多重序列比对 的动态规 划算法、CLUSTAL W 算法。 教学内容: 4.1 多重序列比对 的意义 4.2 多重序列比对 算法原理 Multiple sequence alignment4.1 多重序列比对的意义 目的: 发现 多个序列的共性 发现 与结 构和功能相关的保守序列片段 定义 : 设 :有k 个序列s 1 , s 2 , . ,s k ,每个序列由同一个 字母表中的字符组 成,k 大于2 ,通过 插入“ 空位” 操作,使得各序列达到一样 的长 度,从而形成这 些序列的多重比对 。 Biocomputing technology Multiple sequence alignment8 条免疫球蛋白序列片段的多重比对 : 半光氨酸 色氨酸 疏水残基 保守区域 SP得分 Biocomputing technolog

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