1、实用生物信息技术课程第 1 次作业1网络书籍、文档和文献资源检索和应用姓名_ 学号_ 组号_ 日期_年_月_日1. 分子月报（Molecular of the Month）：1) 按功能分类，该网站的生物大分子分为哪几大类？2) 2000 年 12 篇月报中描述的蛋白质分子，你熟悉的有哪些？3) 有关 DNA、rRNA、tRNA 的月报有哪几篇？4) 该网站中和 DNA 复制相关的蛋白质分子有哪些？5) 该网站中介绍的病毒有哪些？6) 该网站中你熟悉的酶分子有哪些？7) 阅读该网站关于血红蛋白的短文，说明其结合和释放氧气时不同亚基之间如何协同作用。8) 阅读该网站关于流感病毒神经氨酸酶（Inf
2、luenza Neuraminidase）的短文，说明其结构特征和作用机制。9) 列举该网站中与你研究方向相关的生物大分子。10) 阅读你最感兴趣的生物大分子，阐述该分子的结构、功能特点。2. 蛋白质分子精选（Protein Spotlight）1) 和分子月报（Molecule of the Month）相比，该网站在文章内容、写作风格、数据库链接、文献引用等方面有什么特点？2) 阅读该网站关于胰岛素分子的短文，说明作者将其称作“20 世纪蛋白质分子的代表”的原因。3) 阅读该网站关于绿色荧光蛋白（GFP）短文（The greenest of us all）以及相关文献，说明该蛋白质分子的结
3、构功能特点。4) 该网站中你最感兴趣的蛋白质分子有哪些？简述它们的生物学功能。5) 该网站中与你研究方向相关的蛋白质分子有哪些？简述它们的生物学功能。3. NCBI 免费书籍（Bookshelf）1) 浏览该免费书籍目录，与你研究方向最相关的书有哪几本？2) 浏览该免费书籍目录，其中生物化学、分子生物学、细胞生物学和遗传学相关书籍有哪些？列出你最感兴趣的书名和作者。3) 采用限制检索条件策略（Limits） ，分别检索生物化学（Biochemistry） 、分子生物学（Molecular Biology）和疾病（Disease）三类书籍中血红蛋白（Hemoglobin） ，比较检索结果。4)
4、列举 3-5 个与你研究课题相关的关键词（英文） ；以上述关键词检索相关类别的书籍，可在哪几本书中检索到相关信息？5) 根据上述检索信息，简述与你研究领域特别是与你课题相关的方面，已有哪些研究基础。4. PubMed 文献摘要数据库1) PubMed 生物医学文献摘要数据库和 PubMed Central 全文数据库有哪些主要区别？2) PubMed 医学主题词（Medical Subject Heading，MeSH）包括哪些大类？生物科学领域（Biological Science Discipline，H01.158）包括哪些学科？生物学学科（Biology，H01.158.273）包括哪
5、些分支？遗传学分支（Genetics，H01.158.273.343）包括哪些研究方向？你的研究方向属于哪个大类？实用生物信息技术课程第 1 次作业2哪个领域？哪个学科？哪个分支？3) 分子生物学（Molecular Biology）同时属于哪几个学科？哪几个分支？包括什么专题研究方向？4) 生物信息学（Bioinformatics）在 MeSH 数据库中归哪个主题词？其研究方向和范围包括哪些？5) 何谓 PubMed 检索时的 Stop 词？常见 Stop 词有哪些？6) 简述 PubMed 高级检索的用法。7) 以作者单位（Affiliation）分别检索农科院和你所在研究所，共检索到多少
6、文献？其中 2013 年以来发表的有多少篇？列出与你研究方向相关的前 10 篇论文目录。8) 以作者单位（Affiliation）分别检索北京大学生命科学学院和北京大学分子医学研究所，共检索到多少文献？其中 2013 年以来发表的有多少篇？列出与你研究方向相关的论文目录。9) 以你研究方向和课题相关的关键词，检索 PubMed，共检索到多少篇相关文献？检索你导师或你所在实验室 2000 年以来发表的论文，列出与你研究方向相关的前10 篇论文目录。10) 结合 PubMed 网站帮助文档和用户指南，总结 PubMed 文献检索的策略和经验。5. MyNCBI 用法：1) 如何保存文献检索结果？2) 如何自动获取更新文献？3) 如何将检索结果导入个人文献集（My Bibliography）?4) 如何将个人文献集与他人共享？5) 如何设置文献属性筛选条件（Filter）？6) 如何保存其它数据库检索结果？7) 如何保存 Blast 搜索策略？8) 根据以上具体用法，结合帮助文档，总结 MyNCBI 的特点和用途。
