西大Song 2019.5.3 结构生物学与同源建模 结构生物学与同源建模报告内容 1 、同源建模的基础- 结构生物学 2 、蛋白质结构预测之同源建模 3 、同源建模的基本步骤 4 、同源建模常用软件介绍- 在线服务器 5 、同源建模常用软件介绍- Modeller 6 、模型质量检测1 、结构生物学 结构生物学是以生物大分子特定空间结构、结构的特定 运动与生物学功能的关系为基础,来阐明生命现象及其应用的 科学。 以生物大分子三级结构的确定作为手段,研究生物大分 子的结构与功能关系,探讨生物大分子的作用机制和原理作为 研究目的。三维结构 折叠 进化 关系 晶体或高浓度 溶液中蛋白质 的四级结构 突变、单核苷酸及 保守残基的分布 蛋白质配体 复合物 不同基团的 相关性 形态和静 电属性 表面残基暴露 与分子构成 推测相互作用界面 晶胞堆积 抗原位点 及表面修 饰 缝隙(酶活 性位点) 催化簇/结构功能 motif催化机制 配体和功能 位点 生物 多聚态总结 来说 三维结构 功能 作用机制 分子间互作 功能注释 指导实验 验证功能 确认功能位点 设计和改造 蛋白 药物靶标 设计X- 射线晶