第四讲 从质谱数据鉴定多肽/ 蛋白质 中科院自动化所 李伏欣开场白 在之前的讲座中，我们已经学到了关于蛋白 质组学中的重要工具 质谱仪的知识。 蛋白质组学里，质谱仪的作用是鉴定混合物 中的蛋白质。然而，没有数据分析的辅助， 它是做不到这一点的。讲座大纲 本讲座中，将分别讲述两种鉴定蛋白质的方 法。其一是质量纹鉴定法（Peptide Mass Fingerprinting ），另外一种是二级质谱的数 据库搜索鉴定法（MS/MS Database Searching ）。 我们将简略的介绍质量纹鉴定法。而用更多 的时间讨论用于二级质谱上的方法。多肽质量纹鉴定 多肽质量纹（Peptide Mass Fingerprinting ， PMF ）是从一级质谱（MS ）中鉴定多肽的主 要方法。 多肽质量纹一般都是在MALDI-TOF 仪器的结 果上进行。 其原理就是利用了蛋白序列数据库中的多肽 质量的信息。 我们下面的讨论，先假设一张质谱图对应一 个蛋白。后面会讨论处理多个蛋白的情况。一级质谱图 蛋白质经过酶解后，送入质谱仪，得到一级 质谱。 目前来说，由MALDI-TOF 质谱仪产生的质谱 图精
