分子进化和系统发育Darwin, Charles (1809-1882) The Origin of Species （1859） 共同祖先 化石证据最理想的方法 经典的进化研究方法 然而零散、不完整 形态学证据确定大致的进化框架 经典的进化研究方法分子进化研究 分子进化理论由莱纳斯.鲍林（Linus Pauling）于 1964年提出。 该理论基本假设：核苷酸和氨基酸序列中含有生物 进化历史的全部信息。 ACTCGACTT ACTCGGCTT ACTTGGCTT GCTTGGCTT GCTTGTCTT GATTGTCTC CATTGTCAC CACTATCAC CACTATGAC系统发育分析：研究物种进化和系统分类的一种方 法，常用一种类似树状分支的图形来概括各物种/类 群生物之间的亲缘关系，这种树状分支的图形称为 系统发育树。 系统发 育(phylogeny) 相关概念Tree of Life： 重建所有生物 的进化历史并 以系统树的形 式加以描述。分子进化研究系统进化树 16S rDNA分子进化研究物种分类分子进化研究人类起源（Out of Africa ） 线粒体基因组(16,
