NCBI中Blast序列比对小总结(共3页).doc

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精选优质文档-倾情为你奉上NCBI中Blast可以用来进行序列比对、检验引物特异性 Blast导航主页面主体包括三部分 BLAST Assembled Genomes选择你要对比的物种,点击物种之后即可进入对比页面 Basic BLAST包含5个常用的Blast,每一个都附有简单介绍 Specialized BLAST是一些特殊目的的Blast,如Primer-BLAST、IgBLAST 根据需要做出选择本学期学习了最基本的核苷酸序列的比对点击Basic BLAST部分的nucleotide链接到一个新的页面,打开后的页面特征:大体上包括三个部分 Enter Query Sequence部分可以让我们输入序列,其中的Job Title部分可以为本次工作命一个名字 Choose Search Set部分可以选择要与目的序列比对的物种或序列种类。其中的Entrez Query可以对比对结果进行适当的限制。 Program Selection部分可以选择本次对比的精确度,种内种间等等。其次Blast按钮下面有一个“Algorithm parameters”算法参数,可设置参数。点

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