1、 厦 门 大 学博 士 研 究 生 培 养 方 案（报 表）一级学科名称 ： 生物学专业名称： 微生物学专业代码： 071005厦门大学研究生院制表填表日期：2007 年 3 月 15 日一、主要研究方向序号号研究方向名称 主要研究内容、特色与意义 研究生导师（博导注明）1微生物分子生物学从微生物中筛选和分离功能基因，研究功能基因的结构和功能。构建高效微生物表达系统。将功能基因应用于农业、医药、环境及能源等领域。苏文金(博导)郑天凌(博导)肖湘(博导)龙敏南宋思杨2 微生物药物学 本研究方向着重进行海洋微生物药物的研究与开发。主要从事微生物药物产生菌株的分离筛选，微生物药物的分离及结构测定，微
2、生物药物筛选模型的建立，活性化合物作用机理及侯选药物产业化关键技术的研究。苏文金（博导）沈月毛(博导)郑忠辉宋思杨黄耀坚3 资源与环境微生物学本研究方向主要进行不同生境、不同类群有益微生物资源的挖掘;有害微生物的控制；微生物污染环境、微生物检测和治理环境的研究，并着重进行能源、环保、共生微生物资源与海洋环境微生物方面的研究与开发。郑天凌(博导)肖湘(博导)，黄耀坚钱晓鸣龙敏南二、培养目标、学习年限及学分要求培养目标：（本表可不填政治标准）具有扎实的微生物学的基础理论和系统的专业知识，有广泛的现代生物学知识，熟练掌握微生物学专业研究技能并至少熟练掌握一门外语，具有从事科学研究工作、高等学校教学工
3、作和生物产品开发研究的能力。学习年限： 学制 3 年，在学年限 3-7 年。学分要求：共：12 学分。其中：公共学位课：4 学分专业学位课：6 学分选 修 课：2 学分四、课程设置：（不包括公共学位课）序号 课程编码课 程 名 称 课程类型学分 开课学期周学时/总学时是否双语教学任课教师（职称）1 分子细胞生物学前沿 学位 3 1 3/60 否 细胞生物学博士点各位导师2 生态学前沿 学位 3 1 3/60 否 严重玲（教授）3 微生物学前沿 学位 3 1 3/60 否 郑天凌、沈月毛、苏文金、肖湘教授等4 环境微生物学进展 选修 2 2 2/40 否 郑天凌教授等5 药物微生物学进展 选修
4、2 2 2/40 否 沈月毛教授等课程内容纲要课程编码： 开课学期： 周学时/总学时： 学分： 课程名称：微生物学前沿英文名称：Advance in Microbiology教学方式： 考试方式： 内容提要：第一部分：环境微生物研究新进展：重点介绍环境微生物学、海洋微生物学的若干新概念、新内容，研究新技术、新方法；介绍微生物在治理环境、灾害控制；对有毒有害污染物的生物降解，对污染环境的生物修复，对污染物的资源化等方面的作用，以及环境微生物学、海洋微生物学及相关学科紧密渗透，相互交叉所形成的最新研究成果和该学科的发展趋势等。第二部分：微生物次级代谢产物的生物合成：主要内容包括：1）微生物次级代谢
5、的特性；2）微生物次级代谢产物生物合成的基本途径；3）微生物次级代谢产物生物合成的调节机制；4）几种重要的微生物药物的生物合成途径；5）微生物次级代谢产物生物合成基 因簇与药物创新.教材： 参考书：1、张致平主编. 微生物药物学. 北京 : 化学工业出版社, 20032. Raina M. Maier,Lan L. Pepper, Environmental microbiology. 2004 by Science Press. 3 John.H.Paul. ed. Methods In microbiology, Marine Microbiology. San Diego: Academ
6、ic Press, 2001.4中英文专业期刊课程内容纲要-2课程编码： 开课学期： 周学时/总学时： 学分： 课程名称：药物微生物学进展英文名称： Progress in the microbial pharmacy教学方式：讲授、查文献、讨论 考试方式：写综述论文 内容提要：第一章 各类微生物药物的研究现状及进展概况抗生素，抗肿瘤药物，抗病毒药物，降血糖药物，其他药物第二章 微生物药物的作用靶点及其研究进展微生物药物主要作用靶点微生物药物与靶点相互作用的研究方法第三章 药物筛选模型及其研究进展抗生素的筛选，酶抑制剂的筛选，受体拮抗剂/激动剂的筛选，免疫调节剂筛选，其他活性代谢产物的筛选第四
7、章 微生物来源先导化合物的研究策略先导化合物发现流程活性化合物的追踪分离第五章 特殊生境微生物活性物质的研究进展海洋微生物及其活性物质内生菌及其活性物质教材： 参考书：参考书1、张致平主编. 微生物药物学. 北京 : 化学工业出版社, 20032、陈代杰编著. 微生物药物学. 上海 : 华东理工大学出版社, 19993. Tringali C. Bioactive Compounds from Natural Sources: Isolation, Characterization and Biological Properties. London:Taylor & Francis, 2001
8、.4、中英文专业期刊程内容纲要-3课程编码： 开课学期： 周学时/总学时： 学分： 课程名称：环境微生物学进展英文名称： Progress in Environmental Microbiology教学方式：讲授、查文献、讨论 考试方式：写综述论文 主要内容(选择使用)：1，The Formation, Impacts and Global (Including the Arctic and Antarctic Waters) Distribution of Harmful Algal Blooms (HABs)2，Advance in Research on the Interaction
9、of Red-tide and Marine Microbes3，Some Prospect of Study on the Bioremediatin of Marine Polluted Environment4，Role of decomposition, aggregation and dissolution of diatoms in the sinking flux of organic matter to the mesopelagic layer 5，Microbial degradation of phytoplankton-derived organic matter in
10、 seawater ： an experimental approach 6，Biomagnification in the marine environment: Does it occur?7，Molecular Techniques in Microbial Oceanography8，Major Breakthroughs in Marine Microbial Ecology：An Overview9，Exploring Microbial Diversity and Function in the Sea10，Co-variation of Synechococcus and Cy
11、anophages in the Marine Environment11，High Throughput Techniques for Analyzing Complex Bacterial Communities12， Resolving Mechanisms of Toxicity while pursuing Ecotoxicological Relevance13， Water a precious resource for the future： Techniques for sustainable water use and re-use14，Coastal Biodiversi
12、ty: the species: area relationship16，Molecular Analysis and Biodegrading Communities- linking diversity & function17，Cyanobacterial mats and their possible use in bioremediation主要参考书目：1） Hurst, Christon J. Manual of environmental microbiology. Washington, D.C. : ASM Press,c2002.2） Raina M. Maier,Lan
13、 L. Pepper, Environmental microbiology. 2004 by Science Press. 3） 陈坚等，环境生物技术应用与发展，2001，中国轻工业出版社。4） Applied and Environmental Microbiology, Microbial Ecology 等国内外环境微生物学、生态学最新论文，杂志等。5） John.H.Paul. ed. Methods In microbiology, Marine Microbiology. San Diego: Academic Press, 2001. 四、综合考试的基本要求学科综合考试的要求：
14、（时间、方式、内容、标准及考试形式等）博士生综合考试的时间一般应在第三学期末之前以笔试的形式进行。综合考试的目的是综合考察博士生通过入学后的学习及文献（主要是 SCI 期刊文献）的查阅，对生态学以及与生态学紧密相关学科知识的掌握情况。综合考试的内容应基本涵盖本研究方向的主干内容。考试的形式一般采取笔试为主，口试为辅的办法进行。五、科研能力与学位论文的基本要求科研能力的基本要求：（列出可证明其科研能力与水平的检验标志）1 博士研究生应该具有很强的文献阅读能力，通过阅读本专业方向最新的中、英文相关文献（尤其是 SCI 文献） ，熟悉并掌握本研究领域最新的研究动态。2 熟练掌握本专业常用的实验方法和
15、实验技能。具有较强的野外和实验室的实验观察、记录、分析能力、发现和解决问题和综合总结的能力，同时要求具有一定的课题设计和较强的中、英文科技论文写作能力以及熟练应用计算机进行文字、数据处理和文献检索的能力。3 在读期间，须听取学科前沿热点专题讲座 15 次以上，参加一次以上国际学术会议，积极参加国内学术会议，参加实验室建设和科研项目工作。4 研究生经过三年的学习，从文献查阅、选题、所采用实验技术路线到实验操作，论文撰写、答辩、文章发表等全过程进行系统训练，使学生成为具有敬业、开拓的精神和扎实的生命科学理论基础与分析问题、解决问题的实际能力；具有创造性和思维能力及独立操作能力、分析和解决问题能力的
16、科研素质。能从事微生物科学创新性研究、教学以及相应经济建设及管理的高级人才。5. 博士研究生在论文答辩之前应该至少以第一作者或第二作者（导师为第一作者）公开发表两篇以上的学术论文，其中一篇必须是在 SCI 源期刊上发表，另外两篇是在核心刊物以上的学术刊物上发表。学位论文的基本要求：（包括对开题报告、期中论文检查；学位论文的学术水平、创造性成果等方面的要求）1 博士研究生一般应在第二学期末之前在导师指导下确定研究课题。学位论文课题一般是结合导师的科研项目来选择。2 博士研究生进行学位论文工作的时间不少于一年半。论文工作课题确定后应撰写论文开题报告，并且向导师组作开题报告，听取意见并将实验方案进行
17、进一步的修订和完善。3 学位论文工作期间研究生应定期向导师汇报研究工作的进展以及进一步的工作计划，每学期应至少提交一次书面汇报。4 博士研究生学位论文应包括对所在研究方向的研究动态的详细综述。博士研究生在论文答辩之前应该至少以第一作者或第二作者（导师为第一作者）公开发表三篇学术论文（至少有录用证明） ，其中一篇必须是在 SCI 期刊上发表，另外两篇是在核心刊物以上的学术刊物上发表。5 博士学位论文的评阅及答辩程序按厦门大学研究生院有关文件规定的程序执行。6博士研究生所有原始实验记录材料、数据和图片等资料离校前都应交导师保存。六、其它说明：所在院（系、所、中心）意见：负责人（签名）：年 月 日学位评定分委会验收意见：负责人（签名）：年 月 日研究生院审核意见：院长（签名） 年 月 日
