1、第三章：微生物生态学的基本研究方法2015/12/1 1参考书l 陈声明，林海萍，张立钦主编，微生物生态学导论，高等教育出版社， 2007l 池振明主编， 2005，现代微生物生态学，科学出版社l 杨家新主编， 2004，微生物生态学，化学工业出版社l 宋福强主编， 2008，化学工业出版社l 张素琴 著： 2005， 科学出版社lMolecular Microbial Ecology, A. Mark Osborn & Cindy J. Smith, Taylor & Francis Group, 20052015/12/1 22015/12/1 3专业期刊 Microbial Ecolog
2、y Applied and environmental microbiology Advances in microbial ecology ISME Journal Applied Microbiology and Biotechnology FEMS Microbiology Ecology Frontiers in Microbiology Geomicrobiology Journal Nature Microbiology Review2015/12/1 4你们能够想到什么方法开展 微生物生态学 的研究 ？微生物生态学？研究 微生物 与 其周围生物和非生物环境之间相互关系 的一门学科
3、关注的内容： 主要研究 微生物的分布、种群组成、数量 和 活力 等与 环境 的关系，以及 微生物之间、微生物与高等有机体 之间的相互关系。2015/12/1 51、经典技术和方法直接观察测定培养研究2、生理生化方法3、分子生物学方法4、稳定同位素方法2015/12/1 61、经典技术和方法 直接观察测定l 利用显微镜对样品中的微生物直接观察l 计算数目，测定丝状微生物长度（普通染色、荧光染色）l 优点：直接观察天然样品中微生物的形态和微生物所处的位置l 缺点：样品量少，代表性差2015/12/1 7Hep G2 Cells Stained Using the LIVE/DEAD Cell Im
4、aging Kit, showing green-fluorescent live cells and red-fluorescent dead cells.HeLa cells showing negative staining by ICC/IF using only secondary antibody. The cells were 100% methanol fixed (5 min) and then incubated in 1%BSA / 10% normal goat serum / 0.3M glycine in 0.1% PBS-Tween for 1h to perme
5、abilise the cells and block non-specific protein-protein interactions. The secondary antibody (red) was ab150091 Alexa Fluor 647 goat anti-rabbit IgG (Fc) used at 2g/ml for 1h. DAPI was used to stain the cell nuclei (blue) at a concentration of 1.43M.2015/12/1 82015/12/1 9Archaea in the picture in red, sulfate reducing Bacteria in green. Credit: Annelie Pernthaler/UFZ FISH技术2015/12/1 10
